基因页面:ARMC3
总结吗?
GeneID | 219681年 |
象征 | ARMC3 |
同义词 | CT81 | KU-CT-1 |
描述 | 犰狳重复包含3 |
参考 | MIM: 611226|HGNC: HGNC: 30964|运用:ENSG00000165309|HPRD: 12487|织女:OTTHUMG00000017811 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 10 p12.31 |
帕斯卡假定值 | 0.205 |
胎儿β | -0.497 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg16819392 | 10 | 23326418 | ARMC3 | 4.347的军医 | -0.674 | 0.045 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs4294953 | chr2 | 154365614 | ARMC3 | 219681年 | 0.16 | 反式 | ||
rs9681394 | chr3 | 43256230 | ARMC3 | 219681年 | 0.03 | 反式 | ||
rs9882567 | chr3 | 188988929 | ARMC3 | 219681年 | 0.11 | 反式 | ||
rs1981925 | chr4 | 34348578 | ARMC3 | 219681年 | 1.832 e-5 | 反式 | ||
rs2291715 | chr4 | 75485871 | ARMC3 | 219681年 | 0.12 | 反式 | ||
rs6836195 | chr4 | 120756689 | ARMC3 | 219681年 | 0.04 | 反式 | ||
rs10075513 | chr5 | 117091552 | ARMC3 | 219681年 | 0.11 | 反式 | ||
rs2268637 | chr6 | 39050917 | ARMC3 | 219681年 | 0 | 反式 | ||
rs10953482 | chr7 | 105548000 | ARMC3 | 219681年 | 0.17 | 反式 | ||
rs2524878 | chr7 | 125222418 | ARMC3 | 219681年 | 0.09 | 反式 | ||
rs2524880 | chr7 | 125222519 | ARMC3 | 219681年 | 0.14 | 反式 | ||
rs10958899 | chr9 | 10128700 | ARMC3 | 219681年 | 0.03 | 反式 | ||
rs10958907 | chr9 | 10131580 | ARMC3 | 219681年 | 0.03 | 反式 | ||
rs1322159 | chr9 | 10132695 | ARMC3 | 219681年 | 0.02 | 反式 | ||
rs10958910 | chr9 | 10134759 | ARMC3 | 219681年 | 0.04 | 反式 | ||
rs2140736 | chr15 | 31159211 | ARMC3 | 219681年 | 0.04 | 反式 | ||
rs11656351 | chr17 | 9489574 | ARMC3 | 219681年 | 0.02 | 反式 | ||
rs11080561 | chr18 | 12257229 | ARMC3 | 219681年 | 0.1 | 反式 | ||
rs16951170 | chr18 | 47402487 | ARMC3 | 219681年 | 0.02 | 反式 | ||
rs7268640 | chr20 | 47150267 | ARMC3 | 219681年 | 1.158 e-5 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ARMC3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
森古普塔鼻咽癌DN | 349年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗2 | 473年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO和H3K9ME3肝癌 | 141年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过甲基化NOUSHMEHR GBM沉默 | 50 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RAO受SALL4同种型 | 182年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |