基因页：FBLN2
概括？
| 基因 | 2199 |
| 象征 | FBLN2 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 斐杜蛋白2 |
| 参考 | MIM：135821|HGNC：HGNC：3601|Ensembl：ENSG00000163520|HPRD：00630|Vega：Otthumg00000155437 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P25.1 |
| Pascal P值 | 0.815 |
| Sherlock P值 | 0.766 |
| 胎儿β | -2.424 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23043139 | 3 | 13678918 | FBLN2 | 1.46E-4 | 0.345 | 0.031 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17646919 | CHR22 | 30400860 | FBLN2 | 2199 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SIGLEC10 | 0.87 | 0.79 |
| FCGR2A | 0.84 | 0.78 |
| laptm5 | 0.83 | 0.78 |
| ITGB2 | 0.83 | 0.77 |
| NCKAP1L | 0.82 | 0.75 |
| SIGLEC8 | 0.82 | 0.72 |
| LCP1 | 0.82 | 0.76 |
| HCK | 0.82 | 0.72 |
| TLR7 | 0.80 | 0.71 |
| CD53 | 0.80 | 0.77 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC098691.2 | -0.27 | -0.36 |
| AF347015.18 | -0.24 | -0.27 |
| AC016705.1 | -0.23 | -0.21 |
| AC010300.1 | -0.22 | -0.30 |
| anp32c | -0.21 | -0.20 |
| MT-CO2 | -0.21 | -0.27 |
| AF347015.21 | -0.21 | -0.24 |
| AC100783.1 | -0.21 | -0.22 |
| AF347015.26 | -0.21 | -0.22 |
| AC073957.1 | -0.21 | -0.21 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 去：0005509 | 钙离子结合 | 塔斯 | 7806230 | |
| 去：0005201 | 细胞外基质结构成分 | 塔斯 | 7806230 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005578 | 蛋白质细胞外基质 | 塔斯 | 7806230 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 一个罐头 | AGC1 |Agcan |CSPG1 |CSPGCP |MSK16 |塞克 | Aggrecan | - | HPRD，Biogrid | 11038354 |
| BCAN | behab |CSPG7 |MGC13038 | Brevican | - | HPRD，Biogrid | 11038354 |
| COL18A1 | FLJ27325 |FLJ34914 |kno |kno1 |MGC74745 | 胶原蛋白，XVIII类型，Alpha 1 | - | HPRD | 10544250 |
| Col4a1 | 逮捕 | 胶原蛋白，IV型，Alpha 1 | - | HPRD，Biogrid | 7500359 |
| COL4A2 | DKFZP686I14213 |FLJ22259 | 胶原蛋白，IV型，Alpha 2 | - | HPRD，Biogrid | 7500359 |
| Col4a3 | - | 胶原蛋白，IV型，Alpha 3（Goodpasture抗原） | - | HPRD，Biogrid | 7500359 |
| Col4a4 | CA44 | 胶原蛋白，IV型，Alpha 4 | - | HPRD，Biogrid | 7500359 |
| Col4a5 | asln |ATS |CA54 |MGC167109 |MGC42377 | 胶原蛋白，IV型，Alpha 5 | - | HPRD，Biogrid | 7500359 |
| Col4a6 | MGC88184 | 胶原蛋白，IV型，Alpha 6 | - | HPRD，Biogrid | 7500359 |
| Eln | FLJ38671 |FLJ43523 |svas |WBS |WS | 弹性 | - | HPRD，Biogrid | 10544250 |
| FBLN2 | - | 斐杜蛋白2 | - | HPRD，Biogrid | 9214621 |
| FBN1 | fbn |质量|MFS1 |八月|SGS |WMS | 纤维蛋白1 | Fibrillin-1与菲林-2相互作用。 | 绑定 | 8702639 |
| FBN1 | fbn |质量|MFS1 |八月|SGS |WMS | 纤维蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 8702639|9886271 |
| FN1 | CIG |DKFZP686F10164 |DKFZP686H0342 |DKFZP686I1370 |DKFZP686O13149 |ed-b |Finc |fn |fnz |gfnd | GFND2 | LETS | MSF | 纤连蛋白1 | - | HPRD | 10848816 |
| HSPG2 | PLC |prcan |sja |SJS |SJS1 | 硫酸乙酰肝素蛋白聚糖2 | - | HPRD | 9431988 |
| HSPG2 | PLC |prcan |sja |SJS |SJS1 | 硫酸乙酰肝素蛋白聚糖2 | 重构的复合物 | Biogrid | 11493006 |
| 喇嘛1 | 喇嘛 | 层粘连蛋白，alpha 1 | - | HPRD，Biogrid | 9006922|10934193 |
| 喇嘛5 | KIAA1907 | 层粘连蛋白，α5 | - | HPRD，Biogrid | 9006922 |
| LAMC2 | B2T |BM600 |CSF |EBR2 |ebr2a |lamb2t |lamnb2 |MGC138491 |MGC141938 | 层粘连蛋白，伽玛2 | - | HPRD | 11733994 |
| NID1 | nid | nidogen 1 | - | HPRD，Biogrid | 7500359|11493006 |
| 预告片 | MGC45323 |MST161 |MSTP161 |slrr2a | 脯氨酸/精氨酸富含亮氨酸的重复蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 11847210 |
| VCAN | CSPG2 |DKFZP686K06110 |Ervr |PG-M |WGN |WGN1 | versican | - | HPRD，Biogrid | 11038354 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Castellano NRAS靶向DN | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SASAI对肿瘤转移的耐药性 | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gotzmann上皮到间充质过渡 | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 唱歌转移基质 | 110 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer Dena Up | 60 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 纳德勒肥胖 | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 郭十六进制目标 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤尖峰 | 22 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iglesias E2F目标 | 151 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向 | 175 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伯顿成生7 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramaswamy转移 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Calorie限制肌肉DN | 51 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏4NQO | 38 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦加维因结肠癌的甲基化沉默 | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Labbe Wnt3a靶向 | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Labbe TGFB1靶向 | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TGFB1和WNT3A的LABBE目标 | 111 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1靶向1小时 | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM糖蛋白 | 196 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-128 | 355 | 362 | 1A，M8 | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
| HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||