基因页面:TPCN2
总结吗?
| GeneID | 219931年 |
| 象征 | TPCN2 |
| 同义词 | SHEP10 | TPC2 |
| 描述 | 两个孔段通道2 |
| 参考 | MIM: 612163|HGNC: HGNC: 20820|运用:ENSG00000162341|HPRD: 18218|织女:OTTHUMG00000167898 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q13.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.08 |
| 夏洛克假定值 | 0.704 |
| 胎儿β | 0.326 |
| eGene | 小脑半球 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10750839 | chr11 | 68832729 | TPCN2 | 219931年 | 0.06 | 独联体 | ||
| rs10792020 | chr11 | 68842490 | TPCN2 | 219931年 | 0.03 | 独联体 | ||
| rs10896422 | chr11 | 68863323 | TPCN2 | 219931年 | 0.08 | 独联体 | ||
| rs17542473 | chr4 | 111182451 | TPCN2 | 219931年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs4275005 | chr5 | 116412453 | TPCN2 | 219931年 | 0.09 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| VECCHI胃癌早期DN | 367年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌11 q12 Q14扩增子 | 158年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌DN | 540年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BHATI G2M逮捕2 methoxyestradiol DN | 127年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 汉SATB1 DN的目标 | 442年 | 275年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 蒋介石肝癌未经子类 | 85年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大与H3K4ME3 ICP | 445年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |