概括
基因 220
象征 aldh1a3
同义词 aldh1a6 | aldh6 | mcop8 | raldh33
描述 醛脱氢酶1家族成员A3
参考 MIM:600463|HGNC:HGNC:409|ENSEMBL:ENSG00000184254|HPRD:02713|Vega:Otthumg00000186439
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q26.3
Pascal P值 0.099
胎儿β 0.111
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23191950 15 101419074 aldh1a3 4.41E-5 -0.526 0.021 DMG:Wockner_2014
CG22384395 15 101429537 aldh1a3 5.766E​​-4 0.483 0.049 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
9月2日 0.87 0.85
PSAT1 0.85 0.77
ABHD4 0.84 0.76
pttg1ip 0.84 0.74
Sult1c4 0.81 0.77
NXT2 0.80 0.69
PLOD2 0.80 0.72
GNG12 0.79 0.70
达斯 0.79 0.73
Heatr5a 0.78 0.70
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM159B -0.28 -0.14
AL022328.1 -0.28 -0.17
RP9P -0.27 -0.23
SLC26A4 -0.27 -0.27
AC135724.1 -0.26 -0.18
C17orf84 -0.25 -0.13
AF347015.21 -0.25 -0.11
AL353354.3 -0.24 0.03
AC021914.1 -0.23 -0.07
AC022692.2 -0.22 -0.10

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG糖酵解糖异生 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg组氨酸代谢 29 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg酪氨酸代谢 42 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG苯丙氨酸代谢 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
细胞色素P450的异种生物的KEGG代谢 70 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG药物代谢细胞色素P450 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌 96 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与导管正常DN 198 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corre多发性骨髓瘤 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冷吉非替尼抵抗DN 230 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kerley对Cisplatin的反应 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王食道癌与正常DN 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Seitz肿瘤转化通过8p删除 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼衰老 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼永生dn 34 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应120 MCF10A 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿米特血清反应240 MCF10A 57 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林被肿瘤微环境沉默 108 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌15Q26 AMPLICON 22 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素的反应 86 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典DN 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康(Kang)由tert dn永生 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu Crebbp目标DN 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hanson HRAS通过NFKB发出信号 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C4的反应 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang被甲基化沉默 32 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 104 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mellman Tut1靶向DN 47 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1和SATB1的Purbey目标 87 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 10HR DN信号传导 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔祖先 58 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因