概括
基因 2202
象征 EFEMP1
同义词 dhrd | drad | fbln3 | fbnl | fibl-3 | mlvt | mtlv | s1-5
描述 EGF含有腓蛋白样细胞外基质蛋白1
参考 MIM:601548|HGNC:HGNC:3218|ENSEMBL:ENSG00000115380|HPRD:03331|Vega:Otthumg00000129343
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P16
Pascal P值 0.003
Sherlock P值 0.175
胎儿β -2.85
主持人 额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7573869 CHR2 21943124 EFEMP1 2202 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
procr 0.71 0.65
TIMP1 0.70 0.77
TGFB1 0.69 0.74
OLFML3 0.68 0.52
TCN2 0.66 0.68
S100A11 0.65 0.74
FOLR2 0.65 0.63
Cyba 0.63 0.72
lyl1 0.63 0.67
CFI 0.63 0.54
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF514 -0.35 -0.37
ZNF343 -0.34 -0.38
RBM25 -0.34 -0.39
ZNF382 -0.34 -0.35
CEP63 -0.34 -0.45
LRRFIP2 -0.34 -0.42
ZFC3H1 -0.34 -0.38
AC073995.1 -0.33 -0.27
TSSK4 -0.33 -0.35
ZRSR2 -0.33 -0.37

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
早期的粉刺开发 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pramoonjago Sox4靶向DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bogni治疗与髓样白血病有关 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄端癌DN 82 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
沙unaoda顺铂抗性 15 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU细胞迁移 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petretto心脏肥大 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14目标子集 33 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF信号DN 90 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc DN 63 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindvall通过Tert Up永生 78 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿Vegfa目标 108 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时DN 91 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿·维加法(Weston Vegfa)目标3小时 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Masri对他莫昔芬和芳香酶抑制剂DN的耐药性 20 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Le滑雪目标DN 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存率不佳 31 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦加维因结肠癌的甲基化沉默 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
huper乳房基础与腔内DN 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC靶向DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Demagalhaes老化 55 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时DN 91 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向 163 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
雌激素压抑的malik 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM糖蛋白 196 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因