Gene Page:FBP1

概括?
基因 2203
Symbol FBP1
Synonyms FBP
Description fructose-bisphosphatase 1
Reference MIM：611570|HGNC:HGNC:3606|Ensembl:ENSG00000165140|HPRD：01973|Vega：Otthumg00000020268
Gene type protein-coding
Map location 9q22.3
Pascal p-value 0.885
Fetal beta -1.188
eGene Cortex
Hippocampus
下丘脑
元

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV：GWASDB Genome-wide Association Studies GWASdb records for schizophrenia
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
C9orf102 0.89 0.91
C3orf63 0.89 0.90
C12orf30 0.89 0.90
MAP3K2 0.88 0.90
HLTF 0.88 0.90
IBTK 0.88 0.89
UBR1 0.87 0.91
GPR107 0.87 0.90
YTHDC2 0.87 0.90
LYST 0.87 0.90
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.31 -0.70 -0.75
MT-CO2 -0.69 -0.75
AF347015.27 -0.68 -0.72
AF347015.8 -0.68 -0.74
FXYD1 -0.67 -0.71
AF347015.21 -0.67 -0.74
HIGD1B -0.67 -0.73
AF347015.33 -0.66 -0.70
MT-CYB -0.66 -0.71
IFI27 -0.65 -0.70

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0004331 fructose-2,6-bisphosphate 2-phosphatase activity TAS 8387495
GO:0016787 hydrolase activity IEA -
GO:0008270 zinc ion binding IEA -
GO:0042578 phosphoric ester hydrolase activity IEA -
GO:0042132 fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase activity 经验 9382095
GO:0042132 fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase activity IEA -
GO:0042802 identical protein binding 新闻学会 16169070
生物过程 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006094 gluconeogenesis IEA -
GO:0006000 fructose metabolic process TAS 7558035
GO:0005975 carbohydrate metabolic process IEA -
Cellular component GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005829 cytosol 经验 9382095
GO:0005739 mitochondrion IDA 18029348

Section V. Pathway annotation

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG糖酵解糖异生 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PENTOSE PHOSPHATE PATHWAY 27 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FRUCTOSE AND MANNOSE METABOLISM 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG INSULIN SIGNALING PATHWAY 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组糖异生 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF CARBOHYDRATES 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GLUCOSE METABOLISM 69 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU PROSTATE CANCER UP 96 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL UP 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE BREAST CANCER ESR1 UP 112 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMIRNOV CIRCULATING ENDOTHELIOCYTES IN CANCER UP 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 UP 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER WITH LOH IN CHR9Q 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌簇2 42 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG BREAST CANCER ESR1 UP 36 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SUZ12 TARGETS 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH EED TARGETS 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES WITH H3K27ME3 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH PRC2 TARGETS 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MAGRANGEAS MULTIPLE MYELOMA IGG VS IGA DN 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSS AML WITH MLL FUSIONS 78 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAJIMA EOSINOPHIL 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO LIVER SPECIFIC GENES 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB TARGETS 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LENAOUR DENDRITIC CELL MATURATION DN 128 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿布得生活信号1 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK AML WITH NPM1 MUTATED UP 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan V2晚分化基因 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WESTON VEGFA TARGETS 6HR 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY UP 86 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WESTON VEGFA TARGETS 108 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 12HR UP 111 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 6HR UP 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BONE UP 97 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER LUMINAL B UP 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOCHKIS FOXA2 TARGETS 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUELLER PLURINET 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO CSF2RB AND IL4 DN 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 UP 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANTVEER BREAST CANCER ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEDDEN肺可以CER GOOD SURVIVAL A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN MEF HCP WITH H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
穆萨糖异生 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha糖酵解 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZEMBUTSU SENSITIVITY TO CISPLATIN 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI INDUCED T TO NATURAL KILLER DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS TRETINOIN RESPONSE UP 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1 TARGETS DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SERVITJA ISLET HNF1A TARGETS DN 109 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RATTENBACHER BOUND BY CELF1 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因