基因页：NSUN6
概括？
| 基因 | 221078 |
| 象征 | NSUN6 |
| 同义词 | 4933414e04rik | arl5b-as1 | nopd1 |
| 描述 | NOP2/太阳RNA甲基转移酶家族成员6 |
| 参考 | HGNC：HGNC：23529|ENSEMBL：ENSG00000241058|HPRD：14843|Vega：Otthumg0000000017767 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 10p12.31 |
| Pascal P值 | 2.238E-4 |
| Sherlock P值 | 0.837 |
| 胎儿β | 0.155 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| LK：是的 | 全基因组协会研究 | 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26536847 | 10 | 18940347 | NSUN6 | 7.66e-9 | -0.021 | 3.74E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7367244 | 0 | NSUN6 | 221078 | 0.19 | 反式 | |||
| RS12257556 | 10 | 18790503 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 2.286E-6 | 0.01 | 114719 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4748474 | 10 | 18790727 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 2.286E-6 | 0.01 | 114495 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4748475 | 10 | 18790980 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.337E-6 | 0.01 | 114242 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12776325 | 10 | 18791529 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.16e-6 | 0.01 | 113693 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4634984 | 10 | 18868840 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 5.468e-7 | 0.01 | 36382 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2691159 | 10 | 18914096 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -8874 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7921366 | 10 | 18914175 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -8953 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10829038 | 10 | 18914931 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -9709 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7077692 | 10 | 18922472 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.701E-6 | 0.01 | -17250 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7098313 | 10 | 18922557 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -17335 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7084525 | 10 | 18922567 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.706E-6 | 0.01 | -17345 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11015263 | 10 | 18925775 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.704E-6 | 0.01 | -20553 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7101352 | 10 | 18927937 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 2.118E-6 | 0.01 | -22715 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7077637 | 10 | 18928274 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -23052 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1352655 | 10 | 18929681 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -24459 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7907153 | 10 | 18931512 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -26290 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1880682 | 10 | 18932172 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.692E-6 | 0.01 | -26950 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11015306 | 10 | 18932702 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -27480 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11015307 | 10 | 18932743 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -27521 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7071897 | 10 | 18933802 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -28580 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS60303763 | 10 | 18934194 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.804E-6 | 0.01 | -28972 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1968961 | 10 | 18935528 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.821E-6 | 0.01 | -30306 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4748503 | 10 | 18936079 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -30857 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7070695 | 10 | 18938943 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -33721 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7095070 | 10 | 18939070 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.708E-6 | 0.01 | -33848 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10829133 | 10 | 18941670 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.695E-6 | 0.01 | -36448 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS66507840 | 10 | 18944699 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.681E-6 | 0.01 | -39477 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10829139 | 10 | 18944975 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.678E-6 | 0.01 | -39753 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12412484 | 10 | 18945380 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.651E-6 | 0.01 | -40158 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11015411 | 10 | 18945939 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.672E-6 | 0.01 | -40717 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4748508 | 10 | 18958646 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 1.667E-6 | 0.01 | -53424 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7086911 | 10 | 18960080 | NSUN6 | ENSG00000241058.1 | 9.756e-7 | 0.01 | -54858 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌亚类未经注释 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TERAO AOX4靶向皮肤 | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |