基因页：FGD2
概括？
| 基因 | 221472 |
| 象征 | FGD2 |
| 同义词 | ZFYVE4 |
| 描述 | FYVE，Rhogef和pH结构域，包含2个 |
| 参考 | MIM：605091|HGNC：HGNC：3664|ENSEMBL：ENSG00000146192|HPRD：05478|Vega：Otthumg0000000014616 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.2 |
| Pascal P值 | 0.358 |
| DEG P值 | DEG：SANDERS_2014：DS1_P = -0.151：DS1_BETA = 0.033300：DS2_P = 4.97E-01：DS2_BETA = -0.034：DS2_FDR = 7.25E-01 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Sanders_2013 | 微阵列 | 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列（LCLS）上的微阵列进行全基因组基因表达谱。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.04433 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS9366917 | CHR6 | 36790665 | FGD2 | 221472 | 0.04 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005089 | Rho鸟苷核苷酸交换因子活性 | IEA | - | |
| 去：0005085 | 鸟苷核苷酸交换因子活性 | ISS | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | ISS | - | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| GO：0031267 | 小GTPase结合 | ISS | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0046847 | 丝状形成 | ISS | 轴突（GO术语级别：10） | - |
| 去：0007010 | 细胞骨架组织 | ISS | - | |
| 去：0008360 | 细胞形状调节 | ISS | - | |
| 去：0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | ISS | - | |
| GO：0035023 | 调节Rho蛋白信号转导的调节 | IEA | - | |
| 去：0043088 | CDC42 GTPase活性的调节 | ISS | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001726 | 荷叶边 | ISS | - | |
| 去：0005794 | 高尔基体 | ISS | - | |
| 去：0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | ISS | - | |
| GO：0030027 | 薄片 | ISS | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Rho GTPases的Reactome信号传导 | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Nrage通过JNK发出死亡的信号 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞死亡信号通过Nrage NRIF和NADE传导 | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 | 81 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha1213信号传导事件 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| coates巨噬细胞M1 vs M2向上 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta EBNA1反相关 | 173 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |