基因页：LEMD2

概括？
基因 221496
象征 LEMD2
同义词 net25 | DJ482C21.1
描述 LEM域包含2
参考 MIM：616312|HGNC：HGNC：21244|ENSEMBL：ENSG00000161904|HPRD：13984|Vega：Otthumg0000000014535
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.31
Pascal P值 1.79E-7
Sherlock P值 0.481
耶和华 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9461864 CHR6 33481468 LEMD2 221496 0.12 顺式
RS16883896 CHR6 34255630 LEMD2 221496 0.19 顺式
RS17629180 CHR6 34285608 LEMD2 221496 0.04 顺式
RS17696583 CHR6 34291764 LEMD2 221496 0.09 顺式
RS4713782 CHR6 34401280 LEMD2 221496 0.11 顺式
RS16829545 CHR2 151977407 LEMD2 221496 1.332E-5 反式
RS3845734 CHR2 171125572 LEMD2 221496 0.04 反式
RS16955618 CHR15 29937543 LEMD2 221496 1.637E-6 反式
RS4711347 6 33735292 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.567E-7 0 21621 gtex_brain_ba24
RS12173787 6 33735471 LEMD2 ENSG00000161904.7 3.913E-7 0 21442 gtex_brain_ba24
RS7774620 6 33736285 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.517E-7 0 20628 gtex_brain_ba24
RS4711348 6 33736295 LEMD2 ENSG00000161904.7 2.041E-7 0 20618 gtex_brain_ba24
RS747694 6 33736490 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.517E-7 0 20423 gtex_brain_ba24
RS943471 6 33738314 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.518E-8 0 18599 gtex_brain_ba24
RS2296744 6 33740382 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.536E-8 0 16531 gtex_brain_ba24
RS4711349 6 33740592 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.533E-8 0 16321 gtex_brain_ba24
RS4713679 6 33742403 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.829E-7 0 14510 gtex_brain_ba24
RS12196293 6 33749151 LEMD2 ENSG00000161904.7 2.375E-8 0 7762 gtex_brain_ba24
RS12190029 6 33749152 LEMD2 ENSG00000161904.7 2.294E-8 0 7761 gtex_brain_ba24
RS6922275 6 33749739 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.581E-8 0 7174 gtex_brain_ba24
RS943474 6 33749834 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.581E-8 0 7079 gtex_brain_ba24
RS943475 6 33749978 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.581E-8 0 6935 gtex_brain_ba24
RS943478 6 33750940 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.658E-8 0 5973 gtex_brain_ba24
RS943479 6 33752013 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.581E-8 0 4900 gtex_brain_ba24
RS2395402 6 33753673 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.581E-8 0 3240 gtex_brain_ba24
RS9394167 6 33754396 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.575E-8 0 2517 gtex_brain_ba24
RS398065692 6 33755116 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.82E-8 0 1797年 gtex_brain_ba24
RS6457741 6 33756026 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.581E-8 0 887 gtex_brain_ba24
RS6929696 6 33759290 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.581E-8 0 -2377 gtex_brain_ba24
RS4711355 6 33759906 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.581E-8 0 -2993 gtex_brain_ba24
RS9357164 6 33761021 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.581E-8 0 -4108 gtex_brain_ba24
RS4711347 6 33735292 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.042E-6 0 21621 gtex_brain_putamen_basal
RS7774620 6 33736285 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.055E-6 0 20628 gtex_brain_putamen_basal
RS4711348 6 33736295 LEMD2 ENSG00000161904.7 2.234E-6 0 20618 gtex_brain_putamen_basal
RS747694 6 33736490 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.901E-7 0 20423 gtex_brain_putamen_basal
RS943471 6 33738314 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.224e-9 0 18599 gtex_brain_putamen_basal
RS2296744 6 33740382 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.034e-9 0 16531 gtex_brain_putamen_basal
RS4711349 6 33740592 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.284E-9 0 16321 gtex_brain_putamen_basal
RS4713678 6 33742097 LEMD2 ENSG00000161904.7 4.639E-8 0 14816 gtex_brain_putamen_basal
RS4713679 6 33742403 LEMD2 ENSG00000161904.7 2.02E-8 0 14510 gtex_brain_putamen_basal
RS12196293 6 33749151 LEMD2 ENSG00000161904.7 5.123e-9 0 7762 gtex_brain_putamen_basal
RS12190029 6 33749152 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.37E-8 0 7761 gtex_brain_putamen_basal
RS6922275 6 33749739 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.512e-9 0 7174 gtex_brain_putamen_basal
RS943474 6 33749834 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.512e-9 0 7079 gtex_brain_putamen_basal
RS943475 6 33749978 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.512e-9 0 6935 gtex_brain_putamen_basal
RS943478 6 33750940 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.519E-9 0 5973 gtex_brain_putamen_basal
RS943479 6 33752013 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.512e-9 0 4900 gtex_brain_putamen_basal
RS2395402 6 33753673 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.512e-9 0 3240 gtex_brain_putamen_basal
RS9394167 6 33754396 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.535E-9 0 2517 gtex_brain_putamen_basal
RS398065692 6 33755116 LEMD2 ENSG00000161904.7 1.519E-8 0 1797年 gtex_brain_putamen_basal
RS6457741 6 33756026 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.512e-9 0 887 gtex_brain_putamen_basal
RS6929696 6 33759290 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.512e-9 0 -2377 gtex_brain_putamen_basal
RS4711355 6 33759906 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.512e-9 0 -2993 gtex_brain_putamen_basal
RS9357164 6 33761021 LEMD2 ENSG00000161904.7 9.512e-9 0 -4108 gtex_brain_putamen_basal
RS2281820 6 33768897 LEMD2 ENSG00000161904.7 5.599E-8 0 -11984 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

细胞成分 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -
去：0005635 核信封 IEA -
去：0005637 核内膜 IEA -
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃SZGR 2.0途径中的基因 信息
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey靶标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gyorffy Mitoxantrone抗性 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇3向上 170 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 424 430 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC