基因页面:KDM1B
总结吗?
| GeneID | 221656年 |
| 象征 | KDM1B |
| 同义词 | AOF1 | C6orf193 | LSD2 | bA204B7.3 | dJ298J15.2 |
| 描述 | 赖氨酸demethylase 1 b |
| 参考 | MIM: 613081|HGNC: HGNC: 21577|运用:ENSG00000165097|HPRD: 18524|织女:OTTHUMG00000014316 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 p22.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.173 |
| 胎儿β | 0.223 |
| eGene | 小脑 迈尔斯的顺式和反式 元 |
| 支持 | 染色质重塑基因 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs621071 | chr1 | 182682810 | KDM1B | 221656年 | 0.1 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009055 | 电子载体活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016491 | 氧化还原酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0055114 | 氧化还原 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| VECCHI胃癌早期 | 430年 | 232年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SENESE HDAC1目标了 | 457年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SENESE HDAC3目标了 | 501年 | 327年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌6 p24第22位扩增子 | 21 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH三苯氧胺耐药性DN | 258年 | 160年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 国外RB1目标融合性的 | 567年 | 365年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FEVR CTNNB1目标 | 553年 | 343年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 124.1 | 448年 | 454年 | 1 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir - 129 - 5 - p | 810年 | 817年 | 1、m8 | hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC |
| hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
| mir - 145 | 933年 | 939年 | 1 | hsa - mir - 145 | GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCUU |
| mir - 199 | 932年 | 938年 | 1 | hsa - mir - 199 a | CCCAGUGUUCAGACUACCUGUUC |
| hsa - mir - 199 b | CCCAGUGUUUAGACUAUCUGUUC | ||||
| mir - 450 | 810年 | 816年 | 1 | hsa - mir - 450 | UUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUA |
| mir - 504 | 1104年 | 1110年 | m8 | hsa - mir - 504 | AGACCCUGGUCUGCACUCUAU |
| 米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 | 187年 | 194年 | 1、m8 | hsa - mir - 93大脑 | AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG |
| hsa - mir - 302 a | UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 302 b | UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG | ||||
| hsa - mir - 302 c | UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG | ||||
| hsa - mir - 302 d | UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU | ||||
| hsa - mir - 372 | AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU | ||||
| hsa - mir - 373 | GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU | ||||
| hsa - mir - 520 e | AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 a | AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU | ||||
| hsa - mir - 520 b | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 c | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU | ||||
| hsa - mir - 520 d | AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU | ||||