概括
基因 221662
象征 RBM24
同义词 RNPC6 | DJ259A10.1
描述 RNA结合基序蛋白24
参考 HGNC:HGNC:21539|ENSEMBL:ENSG00000112183|HPRD:15228|Vega:Otthumg0000000014306
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p22.3
Pascal P值 0.461
胎儿β 0.212
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04876424 6 17280551 RBM24 3.578E-4 0.454 0.042 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11143640 Chr9 76258323 RBM24 221662 0.13 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003723 RNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016068 I型超敏反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌基础与间充质DN 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌6p24 P22 Amplicon 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mirlet7a3的Brueckner目标 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Korkola胚胎癌与精液瘤DN 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向 139 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移6 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 1127 1134 1A,M8 HSA-MIR-103 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107 agcagcauuguacgggcuauca
mir-124.1 1080 1087 1A,M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 1079 1086 1A,M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-125/351 324 330 1a HSA-MIR-125B ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A ucccugagacccuuaaccugug
mir-142-5p 1694年 1700 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-143 1180 1187 1A,M8 HSA-MIR-143 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-148/152 1281 1287 M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-151 1207 1214 1A,M8 HSA-MIR-151 Acuagacugaagcucuugagg
mir-199 1600 1606年 1a HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc
mir-219 550 556 1a HSA-MIR-219 ugauuguccaaacgcaauucu
HSA-MIR-219 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-221/222 1214 1220 M8 HSA-MIR-221 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222 agcuacaucuggcuacugggucuc
HSA-MIR-221 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-26 1539年 1546年 1A,M8 HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-34b 336 342 M8 HSA-MIR-34B uaggcagugucauagcugauug
mir-363 1664年 1670年 1a HSA-MIR-363 auugcacgguauccaucuguaa
mir-375 547 553 M8 HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
mir-539 606 612 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-9 595 601 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga