基因页:RBM24
概括?
基因 | 221662 |
象征 | RBM24 |
同义词 | RNPC6 | DJ259A10.1 |
描述 | RNA结合基序蛋白24 |
参考 | HGNC:HGNC:21539|ENSEMBL:ENSG00000112183|HPRD:15228|Vega:Otthumg0000000014306 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p22.3 |
Pascal P值 | 0.461 |
胎儿β | 0.212 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04876424 | 6 | 17280551 | RBM24 | 3.578E-4 | 0.454 | 0.042 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11143640 | Chr9 | 76258323 | RBM24 | 221662 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RBM24_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003723 | RNA结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016068 | I型超敏反应 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌基础与间充质DN | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌6p24 P22 Amplicon | 21 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mirlet7a3的Brueckner目标 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Korkola胚胎癌与精液瘤DN | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoelzel NF1靶向 | 139 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工型的Pedersen转移6 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-103/107 | 1127 | 1134 | 1A,M8 | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
mir-124.1 | 1080 | 1087 | 1A,M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-124/506 | 1079 | 1086 | 1A,M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-125/351 | 324 | 330 | 1a | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||
mir-142-5p | 1694年 | 1700 | 1a | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
mir-143 | 1180 | 1187 | 1A,M8 | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
mir-148/152 | 1281 | 1287 | M8 | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
mir-151 | 1207 | 1214 | 1A,M8 | HSA-MIR-151脑 | Acuagacugaagcucuugagg |
mir-199 | 1600 | 1606年 | 1a | HSA-MIR-199A | cccaguucagacuaccuguuc |
HSA-MIR-199B | cccaguguuuagacuaucuuc | ||||
mir-219 | 550 | 556 | 1a | HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu |
HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu | ||||
mir-221/222 | 1214 | 1220 | M8 | HSA-MIR-221脑 | agcuacauugucugugggggguc |
HSA-MIR-222脑 | agcuacaucuggcuacugggucuc | ||||
HSA-MIR-221脑 | agcuacauugucugugggggguc | ||||
HSA-MIR-222脑 | agcuacaucuggcuacugggucuc | ||||
mir-26 | 1539年 | 1546年 | 1A,M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
mir-34b | 336 | 342 | M8 | HSA-MIR-34B | uaggcagugucauagcugauug |
mir-363 | 1664年 | 1670年 | 1a | HSA-MIR-363 | auugcacgguauccaucuguaa |
mir-375 | 547 | 553 | M8 | HSA-MIR-375 | uuuguucguucggcucgcguga |
mir-539 | 606 | 612 | 1a | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |
mir-9 | 595 | 601 | M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |