基因页：RNF182
概括？
| 基因 | 221687 |
| 象征 | RNF182 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 环手指蛋白182 |
| 参考 | HGNC：HGNC：28522|ENSEMBL：ENSG00000180537|HPRD：15264|Vega：Otthumg0000000014280 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p23 |
| Pascal P值 | 0.211 |
| Sherlock P值 | 0.649 |
| 胎儿β | 1.934 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0159 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG21730448 | 6 | 13925050 | RNF182 | 2.784e-4 | -0.386 | 0.039 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2068673 | CHR12 | 60333402 | RNF182 | 221687 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌基础与间充质DN | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌6p24 P22 Amplicon | 21 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Traynor Rett综合征 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Cerebellum标记 | 85 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-181 | 1345 | 1352 | 1A，M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-377 | 1543年 | 1549年 | M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
| mir-410 | 1814年 | 1820年 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
| mir-448 | 4 | 11 | 1A，M8 | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |