基因页：SDK1

概括？
基因 221935
象征 SDK1
同义词 -
描述 辅助细胞粘附分子1
参考 MIM：607216|HGNC：HGNC：19307|ENSEMBL：ENSG00000146555|HPRD：07388|Vega：Otthumg00000151733
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p22.2
胎儿β 2.457
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
元
支持 潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 5
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG09461837 7 3341524 SDK1 1.44E-6 -0.46 0.007 DMG：Wockner_2014
CG20648979 7 4287171 SDK1 2.56E-5 0.602 0.017 DMG：Wockner_2014
CG13261883 7 3988772 SDK1 3.188E-4 0.493 0.04 DMG：Wockner_2014
CG26664107 7 4201510 SDK1 3.197E-4 0.248 0.04 DMG：Wockner_2014
CG23972767 7 4277473 SDK1 4.241E-4 0.272 0.045 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7370564 0 SDK1 221935 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌，H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Asgharzadeh神经母细胞瘤生存率差DN 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔 105 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因