基因页面:FOXK1
总结吗?
| GeneID | 221937年 |
| 象征 | FOXK1 |
| 同义词 | FOXK1L |
| 描述 | forkhead盒K1 |
| 参考 | MIM: 616302|HGNC: HGNC: 23480|运用:ENSG00000164916|HPRD: 18750|织女:OTTHUMG00000151739 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 p22 . 1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.047 |
| 胎儿β | -0.402 |
| DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg07642754 | 7 | 4763655 | FOXK1 | 3.1 e-5 | 0.609 | 0.019 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003700 | 转录因子的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016564 | 转录抑制因子活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016563 | 转录激活活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0043565 | sequence-specific DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007519 | 骨骼肌发展 | 国际能源机构 | 神经元(术语层面:8) | - - - - - - |
| 去:0006357 | 监管RNA聚合酶II启动子的转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007275 | 多细胞有机体的发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030154 | 细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0045892 | 负调节转录,依赖dna的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0045893 | 积极的调控转录,依赖dna的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 王CLIM2 DN的目标 | 186年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌7第22位扩增子 | 38 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 格鲁MIR16目标 | 206年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 155 | 529年 | 535年 | 1 | hsa - mir - 155 | UUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGG |
| mir - 181 | 8477年 | 8483年 | m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
| hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
| hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
| mir - 200 bc / 429 | 8428年 | 8434年 | m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
| hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
| hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
| mir - 203.1 | 8412年 | 8418年 | 1 | hsa - mir - 203 | UGAAAUGUUUAGGACCACUAG |
| miR-23 | 8479年 | 8485年 | m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| mir - 323 | 8479年 | 8485年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 365 | 528年 | 534年 | 1 | hsa - mir - 365 | UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU |
| mir - 485 - 3 - p | 214年 | 220年 | m8 | hsa - mir - 485 - 3 - p | GUCAUACACGGCUCUCCUCUCU |