概括
基因 2222
象征 FDFT1
同义词 DGPT | ERG9 | SQS | SS
描述 farneyl--磷酸酯Farnesyltransferase 1
参考 MIM:184420|HGNC:HGNC:3629|Ensembl:ENSG0000000079459|HPRD:01694|Vega:Otthumg0000000090801
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p23.1-p22
Pascal P值 0.002
胎儿β 0.587
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02887248 8 11659961 FDFT1 5.75e-8 -0.015 1.47E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
EIF3B 0.85 0.80
HDLBP 0.84 0.83
SUV39H1 0.83 0.79
CHAF1B 0.82 0.79
COG8 0.82 0.83
FTSJD2 0.82 0.82
mettl13 0.82 0.81
FBXO18 0.82 0.81
RBM23 0.81 0.84
P4HB 0.81 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.70 -0.71
AF347015.31 -0.69 -0.66
MT-CO2 -0.69 -0.66
AF347015.8 -0.68 -0.67
AF347015.33 -0.68 -0.65
AF347015.27 -0.67 -0.66
mt-cyb -0.66 -0.64
AF347015.2 -0.65 -0.61
AF347015.15 -0.64 -0.63
higd1b -0.64 -0.61

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG类固醇生物合成 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Ppara激活基因表达 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胆固醇生物合成 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威尔科克斯对孕酮的反应 152 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP目标DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN 260 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP 265 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 137 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1慢性洛夫 115 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
田中甲基化食管癌中的甲基化 103 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc Up 54 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德勒肥胖DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1靶向DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C8的反应 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成10 30 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Visala对热冲击和衰老的反应 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindvall通过Tert Up永生 78 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee衰老的肌肉DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维萨拉衰老淋巴细胞DN 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 UP 49 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH的响应 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Podar对Ahaphostin DN的反应 18 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 193 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇12的时间反应12 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 157 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肢体芽中的schmidt por目标 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IRS1和IRS2的GUO目标 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍顿SREBF目标 25 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因