概括
基因 2224
象征 FDP
同义词 fpps | fps | porok9
描述 Farnesyl二磷酸合酶
参考 MIM:134629|HGNC:HGNC:3631|ENSEMBL:ENSG00000160752|HPRD:00606|Vega:Otthumg0000000013909
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q22
Sherlock P值 0.154
DEG P值 DEG:ZHAO_2015:P = 5.79E-04:Q = 0.0926
胎儿β 0.639
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Zhao_2015 RNA测序分析 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15470750 1 155278344 FDP -0.02 0.55 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2809658 CHR1 43050395 FDP 2224 0.11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TFAP2C 0.93 0.60
LRIG3 0.89 0.54
jub 0.87 0.58
TNFRSF19 0.87 0.65
LTBP1 0.86 0.71
Col4a6 0.86 0.63
SOX3 0.85 0.50
vim 0.85 0.72
DMRTA2 0.85 0.58
itga2 0.85 0.55
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.33 -0.43
RAMP3 -0.32 -0.29
AF347015.27 -0.32 -0.51
MT-CO2 -0.31 -0.52
AF347015.31 -0.31 -0.49
AF347015.33 -0.31 -0.49
ifi27 -0.31 -0.49
SLC9A3R2 -0.30 -0.21
mt-cyb -0.30 -0.46
HLA-F -0.30 -0.35

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004161 二甲基转移酶活性 IEA -
去:0004337 香烷基转移酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006695 胆固醇生物合成过程 塔斯 2690933
去:0008299 异普尼生物合成过程 IEA -
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg萜类骨干生物合成 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胆固醇生物合成 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威尔科克斯对孕酮的反应 152 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP目标DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌1Q21 AMPLICON 38 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iizuka肝癌进展G1 G2 DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯肝癌 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yu Myc的目标 42 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1靶向DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成10 30 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C6的反应 39 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mody海马新生儿 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weng Por靶向全球 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂响应和XPC向上 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weng Por靶向肝脏 41 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH的响应 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 77 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhang GATA6靶向DN 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 102 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应DN 209 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn颞TGFB1签名DN 138 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇4的时间反应4 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肢体芽中的schmidt por目标 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IRS1和IRS2的GUO目标 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang GATA2靶向DN 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍顿SREBF目标 25 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因