基因页面:HS3ST5
总结吗?
GeneID | 222537年 |
象征 | HS3ST5 |
同义词 | ost5 3-OST-5 | 3 | HS3OST5 | NBLA04021 |
描述 | 乙酰肝素sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 5 |
参考 | MIM: 609407|HGNC: HGNC: 19419|运用:ENSG00000249853|HPRD: 13674|织女:OTTHUMG00000015412 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 6温度系数 |
帕斯卡假定值 | 0.01 |
胎儿β | 1.142 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs13139661 | chr4 | 63399957 | HS3ST5 | 222537年 | 0.13 | 反式 | ||
rs969607 | chr4 | 63403137 | HS3ST5 | 222537年 | 0.06 | 反式 | ||
rs11941778 | chr4 | 63417928 | HS3ST5 | 222537年 | 0.1 | 反式 | ||
rs10253642 | chr7 | 19250373 | HS3ST5 | 222537年 | 0.11 | 反式 | ||
rs6461405 | chr7 | 19255956 | HS3ST5 | 222537年 | 0.09 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HS3ST5_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG粘多糖生物合成硫酸乙酰肝素 | 26 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME HS GAG生物合成 | 31日 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME硫酸乙酰肝素肝素HS插科打诨的新陈代谢 | 52 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME粘多糖代谢 | 111年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME代谢碳水化合物 | 247年 | 154年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ODONNELL TFRC目标了 | 456年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN GOZGIT ESR1目标 | 781年 | 465年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |