概括
基因 2237
象征 fen1
同义词 fen-1 | mf1 | rad2
描述 皮瓣结构特异性核酸内切酶1
参考 MIM:600393|HGNC:HGNC:3650|ENSEMBL:ENSG00000168496|HPRD:02670|Vega:Otthumg00000168162
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q12
Pascal P值 0.094
Sherlock P值 0.702
胎儿β -0.167
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG03114244 11 61560355 fen1 -0.026 0.26 DMG:Nishioka_2013
CG15963971 11 61316764 fen1 -0.034 0.45 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16940571 CHR15 58882791 fen1 2237 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
Apex1 猿|ape-1 |APE1 |apen |顶点|APX |hap1 |ref-1 |参考文献1 顶点核酸酶(多功能DNA修复酶)1 - HPRD,Biogrid 11601988
Arhgdia GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha 两个杂交 Biogrid 16169070
BLM BS |MGC126616 |MGC131618 |MGC131620 |recq2 |recql2 |RECQL3 布卢姆综合症 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 14688284
CCNA2 CCN1 |CCNA 细胞周期蛋白A2 亲和力捕获 - 韦斯特恩
生化活动
重构的复合物
Biogrid 12853968
CDC2 cdc28a |CDK1 |DKFZP686L20222 |MGC111195 细胞分裂周期2,G1至S和G2至M 重构的复合物 Biogrid 12853968
CDK2 p33(CDK2) 细胞周期蛋白依赖性激酶2 - HPRD,Biogrid 12853968
EEF1G EF1G |GIG35 真核翻译伸长因子1伽玛 两个杂交 Biogrid 16169070
EP300 kat3b |P300 E1a结合蛋白p300 - HPRD,Biogrid 11430825
HNRNPA1 HNRPA1 |MGC102835 异质核核糖核蛋白A1 - HPRD,Biogrid 14690413
PCNA MGC8367 增殖细胞核抗原 PCNA与FEN1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人PCNA和FEN1之间的相互作用进行建模的。 绑定 9705499
PCNA MGC8367 增殖细胞核抗原 PCNA与FEN1相互作用。 绑定 9178907
PCNA MGC8367 增殖细胞核抗原 亲和力捕获 - 韦斯特恩
共纯化
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 8876181|9305916
|9545252|11430825
|11601988|12853968
PCNA MGC8367 增殖细胞核抗原 Fen1是PCNA结合蛋白 绑定 12171929
PCNA MGC8367 增殖细胞核抗原 - HPRD 1477073|8876181
|9305916|9545252
|11430825
WRN DKFZP686C2056 |recq3 |recql2 |RECQL3 Werner综合征 - HPRD 12356323
WRN DKFZP686C2056 |recq3 |recql2 |RECQL3 Werner综合征 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 11598021|14688284


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KeGG DNA复制 36 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg基础切除修复 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg非同源结局加入 14 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome碱基切除修复 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AP位点通过多个核苷酸贴片替换途径的反应组分辨率 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
滞后链上的反应组合过程合成 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA的反应组合成 92 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA修复 112 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome染色体维护 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome滞后链合成 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA复制 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV感染 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期 125 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV生命周期的早期阶段 21 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome端粒维护 75 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome从C链中去除皮瓣中间体 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
端粒的Reactome扩展 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome s阶段 109 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA链伸长 30 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sotiriou乳腺癌1级vs 3 151 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML分割与正常静止 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham正常静止与正常分裂DN 87 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时DN 75 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kong E2F3目标 97 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Eguchi细胞周期RB1目标 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化 77 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化CCNE1 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wakasugi有Znf143绑定位点 58 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯蒂宫颈癌增殖簇 140 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
科科拉畸胎瘤 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牛津拉拉或拉尔布靶向 48 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH目标 127 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 167 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 176 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
考夫曼DNA复制基因 147 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1 DN 169 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F绑定的REN 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nemeth炎症反应LPS DN 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1靶向DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vernell视网膜母细胞瘤路径 70 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
zamora nos2靶向 69 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对UV SCC DN的响应 123 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时 156 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成3 101 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IE86 CMV蛋白的歌曲目标 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MMS小鼠淋巴高4小时 36 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时 101 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KALMA E2F1目标 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时 111 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向 113 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂响应和XPC向上 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦响应集群D3 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cardoso对伽马辐射和3AB的反应 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期16小时 40 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild E2F3致癌特征 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra靶向对雌激素DN的反应 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性2D DN 64 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5目标9小时DN 41 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller Plurinet 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC靶向DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Cycling基因 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ishida E2F目标 53 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G23 UP 52 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein ESR1目标 85 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期S 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌ESR1的王转移 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Guillaumond KLF10靶向 51 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因