基因页:fen1
概括?
基因 | 2237 |
象征 | fen1 |
同义词 | fen-1 | mf1 | rad2 |
描述 | 皮瓣结构特异性核酸内切酶1 |
参考 | MIM:600393|HGNC:HGNC:3650|ENSEMBL:ENSG00000168496|HPRD:02670|Vega:Otthumg00000168162 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q12 |
Pascal P值 | 0.094 |
Sherlock P值 | 0.702 |
胎儿β | -0.167 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03114244 | 11 | 61560355 | fen1 | -0.026 | 0.26 | DMG:Nishioka_2013 | |
CG15963971 | 11 | 61316764 | fen1 | -0.034 | 0.45 | DMG:Nishioka_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16940571 | CHR15 | 58882791 | fen1 | 2237 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FEN1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Apex1 | 猿|ape-1 |APE1 |apen |顶点|APX |hap1 |ref-1 |参考文献1 | 顶点核酸酶(多功能DNA修复酶)1 | - | HPRD,Biogrid | 11601988 |
Arhgdia | GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 | RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
BLM | BS |MGC126616 |MGC131618 |MGC131620 |recq2 |recql2 |RECQL3 | 布卢姆综合症 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 14688284 |
CCNA2 | CCN1 |CCNA | 细胞周期蛋白A2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 生化活动 重构的复合物 |
Biogrid | 12853968 |
CDC2 | cdc28a |CDK1 |DKFZP686L20222 |MGC111195 | 细胞分裂周期2,G1至S和G2至M | 重构的复合物 | Biogrid | 12853968 |
CDK2 | p33(CDK2) | 细胞周期蛋白依赖性激酶2 | - | HPRD,Biogrid | 12853968 |
EEF1G | EF1G |GIG35 | 真核翻译伸长因子1伽玛 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
EP300 | kat3b |P300 | E1a结合蛋白p300 | - | HPRD,Biogrid | 11430825 |
HNRNPA1 | HNRPA1 |MGC102835 | 异质核核糖核蛋白A1 | - | HPRD,Biogrid | 14690413 |
PCNA | MGC8367 | 增殖细胞核抗原 | PCNA与FEN1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人PCNA和FEN1之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 9705499 |
PCNA | MGC8367 | 增殖细胞核抗原 | PCNA与FEN1相互作用。 | 绑定 | 9178907 |
PCNA | MGC8367 | 增殖细胞核抗原 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 8876181|9305916 |9545252|11430825 |11601988|12853968 |
PCNA | MGC8367 | 增殖细胞核抗原 | Fen1是PCNA结合蛋白 | 绑定 | 12171929 |
PCNA | MGC8367 | 增殖细胞核抗原 | - | HPRD | 1477073|8876181 |9305916|9545252 |11430825 |
WRN | DKFZP686C2056 |recq3 |recql2 |RECQL3 | Werner综合征 | - | HPRD | 12356323 |
WRN | DKFZP686C2056 |recq3 |recql2 |RECQL3 | Werner综合征 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11598021|14688284 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KeGG DNA复制 | 36 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg基础切除修复 | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg非同源结局加入 | 14 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome碱基切除修复 | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AP位点通过多个核苷酸贴片替换途径的反应组分辨率 | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
滞后链上的反应组合过程合成 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DNA的反应组合成 | 92 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome滞后链合成 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA复制 | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV生命周期的早期阶段 | 21 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome端粒维护 | 75 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome从C链中去除皮瓣中间体 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
端粒的Reactome扩展 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome s阶段 | 109 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA链伸长 | 30 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sotiriou乳腺癌1级vs 3 | 151 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向 | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML分割与正常静止 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham正常静止与正常分裂DN | 87 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时DN | 75 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kong E2F3目标 | 97 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Eguchi细胞周期RB1目标 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化 | 77 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化CCNE1 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wakasugi有Znf143绑定位点 | 58 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗斯蒂宫颈癌增殖簇 | 140 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
科科拉畸胎瘤 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牛津拉拉或拉尔布靶向 | 48 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ingram SHH目标 | 127 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 | 167 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 | 176 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
考夫曼DNA复制基因 | 147 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索B淋巴细胞网络 | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F绑定的REN | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nemeth炎症反应LPS DN | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vernell视网膜母细胞瘤路径 | 70 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
zamora nos2靶向 | 69 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC DN的响应 | 123 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时 | 156 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成3 | 101 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IE86 CMV蛋白的歌曲目标 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MMS小鼠淋巴高4小时 | 36 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时 | 101 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KALMA E2F1目标 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染12小时 | 111 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向 | 113 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂响应和XPC向上 | 202 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦响应集群D3 | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cardoso对伽马辐射和3AB的反应 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成年时期16小时 | 40 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild E2F3致癌特征 | 246 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra靶向对雌激素DN的反应 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性2D DN | 64 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujii YBX1靶向DN | 202 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5目标9小时DN | 41 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ruiz TNC靶向DN | 142 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Cycling基因 | 148 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ishida E2F目标 | 53 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G23 UP | 52 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein ESR1目标 | 85 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kobayashi EGFR信令24小时DN | 251 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期S | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌ESR1的王转移 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Guillaumond KLF10靶向 | 51 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roessler肝癌转移 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |