基因页:aldh3a2
概括?
基因 | 224 |
象征 | aldh3a2 |
同义词 | aldh10 | faldh | sls |
描述 | 醛脱氢酶3家族成员A2 |
参考 | MIM:609523|HGNC:HGNC:403|Ensembl:ENSG00000072210|HPRD:07188|Vega:Otthumg00000059471 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p11.2 |
Pascal P值 | 0.466 |
Sherlock P值 | 0.061 |
胎儿β | 0.093 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02632015 | 17 | 19551762 | aldh3a2 | 2.519E-4 | -0.312 | 0.037 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1867683 | CHR5 | 53928375 | aldh3a2 | 224 | 0.04 | 反式 | ||
SNP_A-1955963 | 0 | aldh3a2 | 224 | 0.1 | 反式 | |||
RS9958208 | CHR18 | 40591083 | aldh3a2 | 224 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ALDH3A2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004029 | 醛脱氢酶(NAD)活性 | IEA | - | |
去:0004030 | 醛脱氢酶[NAD(P)+]活性 | IEA | - | |
去:0004028 | 3-氯亚醛脱氢酶活性 | 塔斯 | 8528251 | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007417 | 中枢神经系统发展 | 塔斯 | 大脑(GO期限:6) | 8528251 |
去:0006081 | 细胞醛代谢过程 | IEA | - | |
去:0008544 | 表皮发展 | 塔斯 | 8528251 | |
去:0007422 | 周围神经系统发展 | 塔斯 | 8528251 | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | 塔斯 | 8528251 | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
去:0005743 | 线粒体内膜 | IEA | - | |
去:0005783 | 内质网 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG糖酵解糖异生 | 62 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg抗坏血酸和醛固酸代谢 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg脂肪酸代谢 | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Valine亮氨酸和异亮氨酸降解 | 44 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg赖氨酸降解 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg精氨酸和脯氨酸代谢 | 54 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg组氨酸代谢 | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg色氨酸代谢 | 40 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg beta丙氨酸代谢 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG甘油代谢 | 49 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg丙酮酸代谢 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg丙酸代谢 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg butanoate代谢 | 34 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg limonene和Pinene降解 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues DCC目标DN | 121 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
障碍癌复发正常样本 | 32 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tang衰老TP53靶向 | 33 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17P11扩增子 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
戈德拉斯体内平衡增殖 | 171 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML带有MLL融合 | 78 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert)目标DN | 87 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Dena DN | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌电抗 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Varela ZMPSTE24靶向DN | 38 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mahajan对IL1A DN的反应 | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制肌肉DN | 51 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yegnasubramanian前列腺癌 | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ehlers neuploidy up | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗斯白血病与MLL融合 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Coulouarn颞TGFB1签名DN | 138 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Woo肝癌复发DN | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
winnepenninckx黑色素瘤转移DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向 | 135 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
桑德森PPARA目标 | 15 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |