概括
基因 224
象征 aldh3a2
同义词 aldh10 | faldh | sls
描述 醛脱氢酶3家族成员A2
参考 MIM:609523|HGNC:HGNC:403|Ensembl:ENSG00000072210|HPRD:07188|Vega:Otthumg00000059471
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p11.2
Pascal P值 0.466
Sherlock P值 0.061
胎儿β 0.093
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02632015 17 19551762 aldh3a2 2.519E-4 -0.312 0.037 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1867683 CHR5 53928375 aldh3a2 224 0.04 反式
SNP_A-1955963 0 aldh3a2 224 0.1 反式
RS9958208 CHR18 40591083 aldh3a2 224 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004029 醛脱氢酶(NAD)活性 IEA -
去:0004030 醛脱氢酶[NAD(P)+]活性 IEA -
去:0004028 3-氯亚醛脱氢酶活性 塔斯 8528251
GO:0016491 氧化还原酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007417 中枢神经系统发展 塔斯 大脑(GO期限:6) 8528251
去:0006081 细胞醛代谢过程 IEA -
去:0008544 表皮发展 塔斯 8528251
去:0007422 周围神经系统发展 塔斯 8528251
去:0006629 脂质代谢过程 塔斯 8528251
GO:0055114 还原氧化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005743 线粒体内膜 IEA -
去:0005783 内质网 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG糖酵解糖异生 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg抗坏血酸和醛固酸代谢 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg脂肪酸代谢 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Valine亮氨酸和异亮氨酸降解 44 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg赖氨酸降解 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg精氨酸和脯氨酸代谢 54 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg组氨酸代谢 29 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg色氨酸代谢 40 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg beta丙氨酸代谢 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG甘油代谢 49 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg丙酮酸代谢 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg丙酸代谢 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg butanoate代谢 34 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg limonene和Pinene降解 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues DCC目标DN 121 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
障碍癌复发正常样本 32 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tang衰老TP53靶向 33 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤复制编号 181 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17P11扩增子 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML带有MLL融合 78 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert)目标DN 87 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Dena DN 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌电抗 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Varela ZMPSTE24靶向DN 38 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mahajan对IL1A DN的反应 76 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制肌肉DN 51 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1B目标 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yegnasubramanian前列腺癌 128 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ehlers neuploidy up 41 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯白血病与MLL融合 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖DN 179 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn颞TGFB1签名DN 138 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Woo肝癌复发DN 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移DN 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
桑德森PPARA目标 15 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因