基因页:fer
概括?
基因 | 2241 |
象征 | fer |
同义词 | ppp1r74 | tyk3 | p94-fer |
描述 | FER酪氨酸激酶 |
参考 | MIM:176942|HGNC:HGNC:3655|ENSEMBL:ENSG00000151422|HPRD:01491| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q21 |
Pascal P值 | 0.018 |
DEG P值 | DEG:ZHAO_2015:P = 4.85E-04:Q = 0.0926 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Zhao_2015 | RNA测序分析 | 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。 | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0081 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00506247 | 5 | 108084930 | fer | 1.56E-10 | -0.017 | 5E-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FER_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GJD3 | 0.70 | 0.64 |
WDR1 | 0.68 | 0.65 |
TMEM102 | 0.67 | 0.66 |
DCLK3 | 0.67 | 0.63 |
SCARF2 | 0.66 | 0.63 |
CHST8 | 0.66 | 0.63 |
SCMH1 | 0.65 | 0.62 |
TMEM200A | 0.65 | 0.57 |
NRXN2 | 0.64 | 0.63 |
mgat4b | 0.63 | 0.63 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.41 | -0.39 |
AC021016.1 | -0.40 | -0.38 |
AF347015.21 | -0.40 | -0.40 |
AF347015.31 | -0.39 | -0.37 |
AF347015.33 | -0.39 | -0.36 |
MT-CO2 | -0.39 | -0.36 |
S100B | -0.38 | -0.32 |
PPP1R14A | -0.38 | -0.41 |
AF347015.8 | -0.38 | -0.36 |
RBP7 | -0.38 | -0.42 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004715 | 非膜跨度蛋白酪氨酸激酶活性 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007155 | 细胞粘附 | IEA | - | |
去:0007242 | 细胞内信号传导级联 | 塔斯 | 2209086 | |
去:0006935 | 趋化性 | IEA | - | |
GO:0046777 | 蛋白氨基酸自磷酸化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CDH1 | 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO | 钙粘蛋白1,1型,e-钙粘蛋白(上皮) | 重构的复合物 | Biogrid | 12640114 |
CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | Catenin(cadherin相关蛋白),β1,88KDA | 生化活动 | Biogrid | 12640114 |
ctnnd1 | cas |ctnnd |KIAA0384 |P120CAS |P120CTN |P120 | Catenin(钙粘蛋白相关蛋白),三角洲1 | - | HPRD | 12640114 |
cttn | EMS1 |FLJ34459 | cortactin | - | HPRD,Biogrid | 9722593 |
DNM1 | DNM | Dynamin 1 | 共同分级 | Biogrid | 9722593 |
DNM2 | cmtdi1 |cmtdib |di-cmtb |dyn2 |dynii | Dynamin 2 | 共同分级 | Biogrid | 9722593 |
DNM3 | KIAA0820 |MGC70433 | Dynamin 3 | 共同分级 | Biogrid | 9722593 |
egfr | ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 | 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) | - | HPRD,Biogrid | 7623846 |
fer | tyk3 | FER(FPS/FES相关)酪氨酸激酶 | 生化活动 | Biogrid | 9722593 |
Stat3 | APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 | 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) | - | HPRD | 10878010 |
Stat3 | APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 | 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) | - | HPRD | 10878010|12738762 |
TMF1 | ARA160 | 塔塔元件调节因子1 | - | HPRD,Biogrid | 9742951 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg粘附交界处 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FCER1途径 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PTP1B途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID套件途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID NCADHERIN途径 | 33 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCF套件的Reactome信号传导 | 78 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌吸烟者 | 80 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由Kras Pten Up | 181 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Firestein CTNNB1途径 | 33 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |