概括
基因 2241
象征 fer
同义词 ppp1r74 | tyk3 | p94-fer
描述 FER酪氨酸激酶
参考 MIM:176942|HGNC:HGNC:3655|ENSEMBL:ENSG00000151422|HPRD:01491|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q21
Pascal P值 0.018
DEG P值 DEG:ZHAO_2015:P = 4.85E-04:Q = 0.0926
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Zhao_2015 RNA测序分析 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0081

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00506247 5 108084930 fer 1.56E-10 -0.017 5E-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GJD3 0.70 0.64
WDR1 0.68 0.65
TMEM102 0.67 0.66
DCLK3 0.67 0.63
SCARF2 0.66 0.63
CHST8 0.66 0.63
SCMH1 0.65 0.62
TMEM200A 0.65 0.57
NRXN2 0.64 0.63
mgat4b 0.63 0.63
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.41 -0.39
AC021016.1 -0.40 -0.38
AF347015.21 -0.40 -0.40
AF347015.31 -0.39 -0.37
AF347015.33 -0.39 -0.36
MT-CO2 -0.39 -0.36
S100B -0.38 -0.32
PPP1R14A -0.38 -0.41
AF347015.8 -0.38 -0.36
RBP7 -0.38 -0.42

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004715 非膜跨度蛋白酪氨酸激酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007155 细胞粘附 IEA -
去:0007242 细胞内信号传导级联 塔斯 2209086
去:0006935 趋化性 IEA -
GO:0046777 蛋白氨基酸自磷酸化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CDH1 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO 钙粘蛋白1,1型,e-钙粘蛋白(上皮) 重构的复合物 Biogrid 12640114
CTNNB1 ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 Catenin(cadherin相关蛋白),β1,88KDA 生化活动 Biogrid 12640114
ctnnd1 cas |ctnnd |KIAA0384 |P120CAS |P120CTN |P120 Catenin(钙粘蛋白相关蛋白),三角洲1 - HPRD 12640114
cttn EMS1 |FLJ34459 cortactin - HPRD,Biogrid 9722593
DNM1 DNM Dynamin 1 共同分级 Biogrid 9722593
DNM2 cmtdi1 |cmtdib |di-cmtb |dyn2 |dynii Dynamin 2 共同分级 Biogrid 9722593
DNM3 KIAA0820 |MGC70433 Dynamin 3 共同分级 Biogrid 9722593
egfr ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) - HPRD,Biogrid 7623846
fer tyk3 FER(FPS/FES相关)酪氨酸激酶 生化活动 Biogrid 9722593
Stat3 APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) - HPRD 10878010
Stat3 APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) - HPRD 10878010|12738762
TMF1 ARA160 塔塔元件调节因子1 - HPRD,Biogrid 9742951


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg粘附交界处 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FCER1途径 62 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PTP1B途径 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID套件途径 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NCADHERIN途径 33 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCF套件的Reactome信号传导 78 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌吸烟者 80 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由Kras Pten Up 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein CTNNB1途径 33 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因