SZGR2 - Beplay体育中心

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基因	2243
象征	FGA
Synonyms	FIB2
Description	纤维蛋白原α链
Reference	MIM：134820\|HGNC:HGNC:3661\|Ensembl:ENSG00000171560\|HPRD:00619\|Vega：Otthumg00000150330
基因类型	蛋白质编码
Map location	4Q28
Pascal p-value	0.667
胎儿β	0.3

Gene in Data Sources

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
简历:PGCnp	全基因组协会研究	GWAS
PMID：cooccur	High-throughput literature-search	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature	High-throughput literature-search	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症	点击显示详细信息
go_annotation	将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释	与神经相关的关键字的命中：1

Section I. Genetics and epigenetics annotation

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
Gene	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
GRB2	0.86	0.89
CCDC109A	0.84	0.89
arl8a	0.83	0.85
XPNPEP1	0.83	0.86
aasdhppt	0.82	0.85
RAB11A	0.82	0.86
PNMA1	0.82	0.83
YWHAZ	0.82	0.84
Rab1a	0.82	0.84
ARPC2	0.82	0.85

前10个负共表达基因
Gene	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
MT-CO2	-0.72	-0.72
AF347015.2	-0.70	-0.73
AF347015.33	-0.70	-0.72
AF347015.31	-0.70	-0.72
AF347015.8	-0.69	-0.71
mt-cyb	-0.69	-0.70
FXYD1	-0.68	-0.71
AF347015.26	-0.68	-0.71
AF347015.27	-0.68	-0.71
AF347015.15	-0.67	-0.69

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005102	受体binding	IEA	神经递质（GO期限：4）	-
去：0030674	蛋白质结合，桥接	IEA		-
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去:0007165	信号转导	IEA		-
去：0030168	血小板激活	IEA		-
GO：0051258	蛋白质聚合	IEA		-
Cellular component	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005576	细胞外区域	经验		2742826\|5084810\|7356959 \|10605720
去：0005576	细胞外区域	nas		14718574
去：0005577	纤维蛋白原复合物	IEA		-
去：0005577	纤维蛋白原复合物	TAS		10467729
去：0005886	质膜	经验		10605720
GO:0031093	血小板α颗粒管腔	经验		5084810

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
BAT2	D6S51 \| D6S51E \| DKFZp686D09175 \| G2	HLA-B相关笔录2	-	HPRD,BioGRID	14667819
CDH5	7B4 \| CD144 \| FLJ17376	钙粘蛋白5，2型（血管内皮）	-	HPRD,BioGRID	11900554
F13A1	F13A	凝结因子XIII，A1多肽	-	HPRD,BioGRID	10956659
F2	pt	coagulation factor II (thrombin)	-	HPRD,BioGRID	1587268\|2133223
FGA	fib2 \|MGC119422 \|MGC119423 \|MGC119425	纤维蛋白原α链	-	HPRD,BioGRID	9689040
FGB	MGC104327 \|MGC120405	纤维蛋白原β链	-	HPRD,BioGRID	12356313
FGG	-	纤维蛋白原γ链	-	HPRD,BioGRID	12356313
HRG	DKFZP779H1622 \|HPRG \|HRGP	富含组氨酸的糖蛋白	-	HPRD,BioGRID	9276466
itga2b	CD41 \| CD41B \| GP2B \| GPIIb \| GTA \| HPA3	整合素，α2B（IIB/IIIA复合物的血小板糖蛋白IIB，抗原CD41）	-	HPRD	11460491
ITGB3	CD61 \| GP3A \| GPIIIa	整合素，β3（血小板糖蛋白IIIA，抗原CD61）	-	HPRD	11460491
nid1	nid	nidogen 1	-	HPRD,BioGRID	1680863
PLAT	DKFZp686I03148 \| T-PA \| TPA	plasminogen activator, tissue	-	HPRD,BioGRID	3088041\|11170397
serpina5	pai3 \|PCI \|planh3 \|Proci	SERPIN肽酶抑制剂，进化枝A（Alpha-1抗蛋白酶，抗胰蛋白酶），成员5	-	HPRD,BioGRID	8384496\|8589203
serpinf2	A2AP \| AAP \| ALPHA-2-PI \| API \| PLI	SERPIN肽酶抑制剂，进化枝F（α-2抗刺蛋白，色素上皮衍生因子），成员2	-	HPRD	10963790\|14751930
THBS1	THBS \| TSP \| TSP1	thrombospondin 1	-	HPRD,BioGRID	9867861

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
kegg补充和凝结级联	69	49	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta AMI途径	20	13	All SZGR 2.0 genes in this pathway
生物卡尔塔外途径	13	9	All SZGR 2.0 genes in this pathway
生物核酸纤维蛋白溶解途径	12	8	All SZGR 2.0 genes in this pathway
生物核心内在途径	23	15	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Integin1途径	66	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Integin3途径	43	25	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Integin2途径	29	18	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID UPA UPAR PATHWAY	42	30	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Ephrinb Rev Pathway	30	25	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME RESPONSE TO ELEVATED PLATELET CYTOSOLIC CA2	89	56	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome整合素细胞表面相互作用	79	48	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome公共途径	14	10	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome P130CAS连接到整合素的MAPK信号传导	15	11	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GRB2 SOS提供了与Intergrins的MAPK信号的联系	15	10	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome整合素alphaiib beta3信号传导	27	17	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME FORMATION OF FIBRIN CLOT CLOTTING CASCADE	32	22	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome血小板聚集插头组	36	23	All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组止血	466	331	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME AMYLOIDS	83	63	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome血小板激活信号传导和聚集	208	138	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE FIMA UP	544	308	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAVARD LIVER CANCER MALIGNANT VS BENIGN	32	19	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dauer Stat3靶向	49	35	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN	514	319	All SZGR 2.0 genes in this pathway
带有E盒的WEI MYCN目标	795	478	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shen Smarca2靶向DN	357	212	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shepard BMYB Morpholino DN	200	112	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HSIAO LIVER SPECIFIC GENES	244	154	All SZGR 2.0 genes in this pathway
kaab失败的心房	38	30	All SZGR 2.0 genes in this pathway
张抗病毒对利巴韦林的反应	30	21	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rizki肿瘤侵入性3D DN	270	181	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌DN	540	340	All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP	1305	895	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G123 DN	51	30	All SZGR 2.0 genes in this pathway
开罗肝脏发展DN	222	141	All SZGR 2.0 genes in this pathway
惠特菲尔德细胞周期g2 m	216	124	All SZGR 2.0 genes in this pathway
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn	88	59	All SZGR 2.0 genes in this pathway
lu eszh2靶向	295	155	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向	504	321	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2靶向DN	882	538	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN	448	282	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Alfano MYC目标	239	156	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA ECM糖蛋白	196	99	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA CORE MATRISOME	275	148	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA MATRISOME	1028	559	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族	目标位置			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
mir-101	128	135	1A，M8	hsa-miR-101	uacaguacugauaacugaag
miR-144	129	135	1a	HSA-MIR-144	UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG
mir-29	107	113	1a	HSA-MIR-29A^SZ	uagcaccaucugaaaucgguu
				HSA-MIR-29B^SZ	UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
				HSA-MIR-29C^SZ	uagcaccauuugaaaucggu

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

基因页：FGA