基因页：FGF13
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| 基因 | 2258 |
| 象征 | FGF13 |
| 同义词 | FGF-13 | FGF2 | FHF-2 | FHF2 |
| 描述 | 成纤维细胞生长因子13 |
| 参考 | MIM：300070|HGNC:HGNC:3670|ENSEMBL：ENSG00000129682|HPRD：02090|Vega：Otthumg0000000022532 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | XQ26.3 |
| Sherlock p-value | 0.555 |
| DEG P值 | DEG：ZHAO_2015：P = 1.30E-04：Q = 0.0733 |
| 胎儿β | 0.273 |
| 主持人 | Myers' cis & trans |
| 支持 | 潜在的突触基因 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG:Zhao_2015 | RNA Sequencing analysis | 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1874981 | CHR3 | 7172720 | FGF13 | 2258 | 0.07 | 反式 | ||
| RS737714 | CHR7 | 9187293 | FGF13 | 2258 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MAGED1 | 0.88 | 0.91 |
| BRWD2 | 0.87 | 0.90 |
| PTPN9 | 0.87 | 0.93 |
| BBS1 | 0.87 | 0.89 |
| FAM108C1 | 0.86 | 0.90 |
| sall2 | 0.86 | 0.86 |
| RPN2 | 0.86 | 0.93 |
| TRO | 0.86 | 0.90 |
| Zmym3 | 0.86 | 0.90 |
| DCP1B | 0.85 | 0.89 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.76 | -0.83 |
| AF347015.27 | -0.75 | -0.83 |
| AF347015.8 | -0.74 | -0.82 |
| AF347015.31 | -0.73 | -0.81 |
| AF347015.21 | -0.73 | -0.85 |
| AF347015.33 | -0.72 | -0.79 |
| mt-cyb | -0.71 | -0.79 |
| FXYD1 | -0.69 | -0.76 |
| AF347015.15 | -0.68 | -0.78 |
| AF347015.2 | -0.68 | -0.79 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12244047 | |
| GO:0008083 | 生长因子活性 | TAS | 8790420 | |
| 去：0030295 | protein kinase activator activity | Igi | 12244047 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | nervous system development | TAS | 神经突（GO期限：5） | 8790420 |
| 去：0000165 | MAPKKK cascade | 艾达 | 12244047 | |
| 去：0007267 | 细胞细胞信号传导 | TAS | 8790420 | |
| 去：0007165 | 信号转导 | TAS | 8790420 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 8790420 | |
| 去：0005737 | cytoplasm | IPI | 12244047 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-142-5p | 516 | 522 | M8 | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
| HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac | ||||
| miR-381 | 1228 | 1234 | 1a | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
| mir-452 | 423 | 429 | 1a | hsa-miR-452 | UGUUUGCAGAGGAAACUGAGAC |
| miR-486 | 1168 | 1174 | M8 | HSA-MIR-486 | uccuguacugagcugcccccgag |
| miR-493-5p | 1166 | 1172 | M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
| mir-505 | 51 | 57 | 1a | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |
| mir-539 | 788 | 794 | M8 | HSA-MIR-539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |
| HSA-MIR-539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU | ||||