基因页：FGFR3

总结?
基因ID 2261
年代ymbol FGFR3
同义词 ACH | CD333 | CEK2 | HSFGFR3EX | JTK4
描述 纤维母细胞生长因子矩形eptor 3
参考 MIM:134934|HGNC：HGNC：3690|Ensembl:ENSG00000068078|HPRD：00624|Vega：Otthumg00000121148
基因type protein-coding
地图位置 4p16.3
Pascal P值 0.676
Sherlock P值 0.043
Fetal beta -3.174
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 年代ystematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
go_annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

年代NP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs16823850 chr3 115274498 FGFR3 2261 0.19 trans

年代ection II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
年代T1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
年代CPEP1 0.54 0.58
AC051642.1 0.53 0.53
coro6 0.52 0.56
ANKRD19 0.51 0.49
PLA2G4C 0.50 0.54
CA7 0.50 0.55
htatip2 0.49 0.46
年代LC48A1 0.49 0.54
TRPV3 0.49 0.51
PPAP2A 0.49 0.49
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.40 -0.49
C19orf57 -0.38 -0.32
DPYSL3 -0.38 -0.31
FAM109A -0.38 -0.37
KIAA1949 -0.37 -0.34
isyna1 -0.37 -0.34
KCTD11 -0.37 -0.35
C1orf187 -0.37 -0.34
FBLIM1 -0.37 -0.35
KIAA1211 -0.37 -0.31

年代ection III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0004872 受体活性 IEA -
GO:0005007 纤维母细胞生长因子矩形eptor activity IEA -
GO:0005007 纤维母细胞生长因子矩形eptor activity NAS 7923141
GO:0005524 ATP结合 IEA -
去：0004713 protein tyrosine kinase activity IEA -
GO:0016740 transferase activity IEA -
GO:0042802 相同的蛋白质结合 新闻学会 14732692
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0030900 forebrain development IEA 大脑（GO期限：8） -
GO:0000165 MAPKKK级联 IEA -
GO:0000165 MAPKKK级联 塔斯 10918587
去：0001501 骨骼系统开发 塔斯 8601314
GO:0002009 上皮细胞的形态发生 IEA -
GO:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
GO:0016049 细胞生长 NAS -
去：0007259 JAK-STAT cascade 塔斯 10918587
GO:0008543 成纤维细胞生长因子受体信号通路 IEA -
GO:0008543 成纤维细胞生长因子受体信号通路 塔斯 10918587
GO:0007605 sensory perception of sound IEA -
去：0043065 positive regulation of apoptosis IEA -
GO：0031398 蛋白质泛素化的阳性调节 IEA -
GO:0050680 上皮细胞增殖的负调节 IEA -
去：0050731 肽基 - 酪氨酸磷酸化的阳性调节 IEA -
GO：0045597 positive regulation of cell differentiation IEA -
GO:0060113 内耳受体细胞分化 IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005764 溶酶体 IEA -
去：0009898 质膜的内侧 IEA -
GO:0005886 质膜 EXP 11294897|16597617
GO:0005887 质膜的积分 塔斯 10918587
GO:0048471 perinuclear region of cytoplasm IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ARAP1 centd2 |KIAA0782 ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1 两个杂交 BioGRID 16169070
ATF3 - 激活转录因子3 两个杂交 BioGRID 16169070
C13orf34 波拉|FLJ22624 染色体13开放阅读框34 两个杂交 BioGRID 16169070
C6orf47 D6S53E | G4 | NG34 染色体6开放阅读框47 - HPRD，Biogrid 14667819
CCDC17 FLJ17921 | FLJ33084 coiled-coil domain containing 17 两个杂交 BioGRID 16169070
CHGB SCG1 chromogranin B (secretogranin 1) 两个杂交 BioGRID 16169070
CTSK CTS02 |CTSO |CTSO1 |CTSO2 |MGC23107 |pknd |pycd 组织蛋白酶K。 两个杂交 BioGRID 16169070
FGF1 AFGF |ECGF |ECGF-beta |ECGFA |ECGFB |fgf-alpha |fgfa |glio703 |HBGF1 成纤维细胞生长因子1（酸性） - HPRD，Biogrid 10574949
FGF8 AIGF | HBGF-8 | MGC149376 fibroblast growth factor 8 (androgen-induced) - HPRD，Biogrid 10574949
FGF9 GAF | HBFG-9 | MGC119914 | MGC119915 fibroblast growth factor 9 (glia-activating factor) - HPRD，Biogrid 8576175|10574949
GRB2 ASH | EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 生长因子受体结合蛋白2 - HPRD，Biogrid 9045692
GTF3C1 DKFZp686A111 | TFIIIC | TFIIIC220 | TFIIICalpha general transcription factor IIIC, polypeptide 1, alpha 220kDa 两个杂交 BioGRID 16169070
HBZ - hemoglobin, zeta 两个杂交 BioGRID 16169070
HNRNPL FLJ35509 |hnrpl |p/okcl.14 |HNRNP-L 异质核核糖核蛋白L 两个杂交 BioGRID 16169070
KIAA1377 - KIAA1377 两个杂交 BioGRID 16169070
KRT8 CARD2 | CK8 | CYK8 | K2C8 | K8 | KO keratin 8 两个杂交 BioGRID 16169070
ndufs6 - NADH脱氢酶（泛氨基酮）Fe-S蛋白6，13KDA（NADH辅酶Q还原酶） 两个杂交 BioGRID 16169070
pola2 FLJ21662 |FLJ37250 polymerase (DNA directed), alpha 2 (70kD subunit) 两个杂交 BioGRID 16169070
radil FLJ10324 |KIAA1849 |MGC161589 RAP GTPASE ITSTORTATER 两个杂交 BioGRID 16169070
RNF130 G1RZFP | GOLIATH | GP | MGC117241 | MGC138647 | MGC99542 ring finger protein 130 两个杂交 BioGRID 16169070
RPL8 - 核糖体蛋白L8 两个杂交 BioGRID 16169070
年代H2B1 DKFZp547G1110 | FLJ30542 | KIAA1299 | SH2-B | SH2B 年代H2B adaptor protein 1 - HPRD，Biogrid 11827956
年代LC25A6 AAC3 |ANT3 |Ant3y |MGC17525 solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 6 两个杂交 BioGRID 16169070
年代MG7 c1orf16 |EST1C |FLJ23717 |KIAA0250 |SGA56M |SMG-7 年代mg-7 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) 两个杂交 BioGRID 16169070


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ENDOCYTOSIS 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHWAYS IN CANCER 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG BLADDER CANCER 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FGF PATHWAY 55 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR信号的Reactome负调节 37 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素受体信号传导级联 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR在疾病中的反应组信号传导 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR3突变体的Reactome信号传导 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY FGFR MUTANTS 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome FRS2介导的级联 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PI 3K CASCADE 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的下游信号传导激活的FGFR 100 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PHOSPHOLIPASE C MEDIATED CASCADE 54 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SHC介导的级联 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY INSULIN RECEPTOR 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome FGFR配体结合和激活 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY FGFR 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PI3K CASCADE 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 12HR UP 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG BARRETTS ESOPHAGUS DN 25 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEREZ TP53 TARGETS 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATTIOLI MULTIPLE MYELOMA WITH 14Q32 TRANSLOCATIONS 36 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AIYAR COBRA1靶向DN 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOOD EBV EBNA1 TARGETS UP 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WATTEL AUTONOMOUS THYROID ADENOMA UP 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
年代CHAEFFER SOX9 TARGETS IN PROSTATE DEVELOPMENT UP 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stanelle E2F1目标 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POMEROY MEDULLOBLASTOMA PROGNOSIS DN 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤尖峰 22 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA MS UP 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML FAB MARKERS 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Munshi多发性骨髓瘤 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
年代ESTO RESPONSE TO UV C8 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时 101 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HEDENFALK BREAST CANCER BRCA1 VS BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEBIASI APOPTOSIS BY REOVIRUS INFECTION DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1 TARGETS DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD E2F3 ONCOGENIC SIGNATURE 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 common 77 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标DN 105 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION UP 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Finetti乳腺癌Kinome Blue 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
恩格曼癌祖细胞dn 70 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼中的Smid乳腺癌复发 97 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向DN 108 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRESHOCK CANCER COPY NUMBER UP 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BEIER GLIOMA STEM CELL UP 39 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takeer吉西他滨抗性DN 122 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Poola侵入性乳腺癌DN 134 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞向上 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S2 115 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAYAMA SOFT TISSUE TUMORS PCA1 DN 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP 87 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时 61 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤经典 162 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-181 296 302 1a hsa-miR-181a脑 aacauucaacgcugucggugagu
hsa-miR-181bSZ aacauucauugcugucggggg
hsa-miR-181c脑 aacauucaaccugucggugagu
hsa-miR-181d脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-186 1123 1129 1a hsa-miR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-194 1262 1268 1a hsa-miR-194 UGUAACAGCAACUCCAUGUGGA
mir-24 422 428 m8 HSA-MIR-24SZ UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG
mir-99/100 537 544 1a,m8 HSA-MIR-99A脑 AACCCGUAGAUCCGAUCUUGUG
HSA-MIR-100脑 AACCCGUAGAUCCGAACUUGUG
HSA-MIR-99B脑 cacccguagaaccgaccuugcg