概括
基因 2275
象征 FHL3
同义词 Slim2
描述 四个半域3
参考 MIM:602790|HGNC:HGNC:3704|ENSEMBL:ENSG00000183386|HPRD:09101|Vega:Otthumg00000004434
基因类型 蛋白质编码
地图位置 134
Pascal P值 0.061
Sherlock P值 0.332
胎儿β 0.264
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG27018070 1 38470578 FHL3 -0.024 0.78 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17275845 CHR2 213836589 FHL3 2275 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
Adamtsl4 TSRC1 类似Adamts的4 两个杂交 Biogrid 16189514
cdc25b - 细胞分裂周期25同源物B(S. pombe) - HPRD 12681290
cdc42ep1 borg5 |CEP1 |MGC15316 |MSE55 CDC42效应蛋白(Rho GTPase结合)1 两个杂交 Biogrid 16189514
CREB1 Creb |MGC9284 cAMP响应元件结合蛋白1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 11046156
CTBP2 - C末端结合蛋白2 - HPRD,Biogrid 12556451
FHL2 AAG11 |Dral |Slim3 四个半域2 - HPRD,Biogrid 11135358
FHL3 MGC19547 |MGC23614 |MGC8696 |Slim2 四个半域3 两个杂交 Biogrid 11046156
FHL3 MGC19547 |MGC23614 |MGC8696 |Slim2 四个半域3 - HPRD 15117962
FHL5 行为|FLJ33049 |KIAA0776 |RP3-393D12.2 |DJ393D12.2 四个半域5 两个杂交 Biogrid 11046156
itga7 FLJ25220 整合素,alpha 7 亲和力捕获 - 韦斯特恩
共定位
两个杂交
Biogrid 15117962
JTV1 AIMP2 |p38 |Pro0992 JTV1基因 两个杂交 Biogrid 16189514
KLF3 BKLF |MGC48279 类似Kruppel的因子3(基本) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 12556451
KLF8 BKLF3 |DKFZP686O08126 |DXS741 |MGC138314 |ZNF741 类似克鲁诗的因子8 - HPRD 12556451
LASP1 LASP-1 |MLN50 LIM和SH3蛋白1 两个杂交 Biogrid 16189514
LNX1 lnx |mpdz |PDZRN2 Numb蛋白X 1的配体 两个杂交 Biogrid 16189514
MAPK1 ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 - HPRD 14729955
Med15 Arc105 |Cag7a |CTG7A |DKFZP686A2214 |DKFZP762B1216 |FLJ42282 |FLJ42935 |PCQAP |tig-1 |tig1 | TNRC7 中介复合体亚基15 两个杂交 Biogrid 16189514
PAK7 KIAA1264 |MGC26232 |PAK5 P21蛋白(CDC42/RAC)激活激酶7 两个杂交 Biogrid 16189514
PHC2 EDR2 |HPH2 |MGC163502 |PH2 多瘤同源物2(果蝇) 两个杂交 Biogrid 16189514
RBM42 MGC10433 RNA结合基序蛋白42 两个杂交 Biogrid 16189514
RFX6 MGC33442 |RFXDC1 |DJ955L16.1 调节因子X,6 两个杂交 Biogrid 16189514
SRF MCM1 血清反应因子(C-FOS血清响应元件结合转录因子) SRF与FHL3相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类SRF和FHL3之间的相互作用进行建模的。 绑定 15610731
Trip6 MGC10556 |MGC10558 |MGC29959 |MGC3837 |MGC4423 |OIP1 |ZRP-1 甲状腺激素受体相互作用6 两个杂交 Biogrid 16189514


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
家长MTOR信号传导DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应240 HELA 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weston Vegfa目标6小时 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿Vegfa目标 108 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向DN 148 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因