基因页:FHL3
概括?
基因 | 2275 |
象征 | FHL3 |
同义词 | Slim2 |
描述 | 四个半域3 |
参考 | MIM:602790|HGNC:HGNC:3704|ENSEMBL:ENSG00000183386|HPRD:09101|Vega:Otthumg00000004434 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 134 |
Pascal P值 | 0.061 |
Sherlock P值 | 0.332 |
胎儿β | 0.264 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG27018070 | 1 | 38470578 | FHL3 | -0.024 | 0.78 | DMG:Nishioka_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17275845 | CHR2 | 213836589 | FHL3 | 2275 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Adamtsl4 | TSRC1 | 类似Adamts的4 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
cdc25b | - | 细胞分裂周期25同源物B(S. pombe) | - | HPRD | 12681290 |
cdc42ep1 | borg5 |CEP1 |MGC15316 |MSE55 | CDC42效应蛋白(Rho GTPase结合)1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
CREB1 | Creb |MGC9284 | cAMP响应元件结合蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 11046156 |
CTBP2 | - | C末端结合蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 12556451 |
FHL2 | AAG11 |Dral |Slim3 | 四个半域2 | - | HPRD,Biogrid | 11135358 |
FHL3 | MGC19547 |MGC23614 |MGC8696 |Slim2 | 四个半域3 | 两个杂交 | Biogrid | 11046156 |
FHL3 | MGC19547 |MGC23614 |MGC8696 |Slim2 | 四个半域3 | - | HPRD | 15117962 |
FHL5 | 行为|FLJ33049 |KIAA0776 |RP3-393D12.2 |DJ393D12.2 | 四个半域5 | 两个杂交 | Biogrid | 11046156 |
itga7 | FLJ25220 | 整合素,alpha 7 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共定位 两个杂交 |
Biogrid | 15117962 |
JTV1 | AIMP2 |p38 |Pro0992 | JTV1基因 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
KLF3 | BKLF |MGC48279 | 类似Kruppel的因子3(基本) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12556451 |
KLF8 | BKLF3 |DKFZP686O08126 |DXS741 |MGC138314 |ZNF741 | 类似克鲁诗的因子8 | - | HPRD | 12556451 |
LASP1 | LASP-1 |MLN50 | LIM和SH3蛋白1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
LNX1 | lnx |mpdz |PDZRN2 | Numb蛋白X 1的配体 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
MAPK1 | ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk | 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 | - | HPRD | 14729955 |
Med15 | Arc105 |Cag7a |CTG7A |DKFZP686A2214 |DKFZP762B1216 |FLJ42282 |FLJ42935 |PCQAP |tig-1 |tig1 | TNRC7 | 中介复合体亚基15 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
PAK7 | KIAA1264 |MGC26232 |PAK5 | P21蛋白(CDC42/RAC)激活激酶7 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
PHC2 | EDR2 |HPH2 |MGC163502 |PH2 | 多瘤同源物2(果蝇) | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
RBM42 | MGC10433 | RNA结合基序蛋白42 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
RFX6 | MGC33442 |RFXDC1 |DJ955L16.1 | 调节因子X,6 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
SRF | MCM1 | 血清反应因子(C-FOS血清响应元件结合转录因子) | SRF与FHL3相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类SRF和FHL3之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15610731 |
Trip6 | MGC10556 |MGC10558 |MGC29959 |MGC3837 |MGC4423 |OIP1 |ZRP-1 | 甲状腺激素受体相互作用6 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长MTOR信号传导DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应240 HELA | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Weston Vegfa目标6小时 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
韦斯顿Vegfa目标 | 108 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向DN | 148 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |