基因页面:XRN2

总结吗?
GeneID 22803年
象征 XRN2
同义词 - - - - - -
描述 5 ' 3 ' exoribonuclease 2
参考 MIM: 608851|HGNC: HGNC: 12836|运用:ENSG00000088930|HPRD: 10309|织女:OTTHUMG00000032025
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 20 p11.2-p11.1
帕斯卡假定值 3.392的军医
夏洛克假定值 0.193
胎儿β 1.751

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:1.9018

部分即遗传学和表观遗传学注释


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIF13A 0.84 0.84
CC2D1B 0.81 0.84
PHLDB1 0.81 0.83
FRYL 0.80 0.81
KIAA0562 0.79 0.82
ZFYVE16 0.79 0.79
RNF213 0.79 0.81
ATP11A 0.79 0.80
WWC3 0.79 0.82
XPC 0.79 0.81
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
UQCR -0.50 -0.60
AC044839.2 -0.49 -0.45
C1orf61 -0.49 -0.45
NDUFB2 -0.49 -0.50
C1orf54 -0.49 -0.48
TIMM8B -0.49 -0.51
UQCRQ -0.48 -0.54
ENHO -0.48 -0.48
IL32 -0.48 -0.50
SERF2 -0.48 -0.50

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003676 核酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 15231747
去:0004534 5 ' 3 ' exoribonuclease活动 助教 10409438
去:0016787 水解酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000738 DNA分解过程,exonucleolytic 艾达 15565158
去:0006353 转录终止 国际能源机构 - - - - - -
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0006397 信使rna加工 国际能源机构 - - - - - -
去:0006350 转录 国际能源机构 - - - - - -
去:0006401 核糖核酸分解过程 助教 10409438
去:0016049 细胞生长 国际空间站 - - - - - -
去:0007283 精子发生 等电位点 10409438
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005622 细胞内的 国际能源机构 - - - - - -
去:0005634 核 助教 10409438
去:0005730 核仁 艾达 12429849

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 源 PubMed ID
COMT的 - - - - - - catechol-O-methyltransferase - - - - - - HPRD, BioGRID 15231747
DOM3Z DOM3L | NG6 dom-3同族体Z(秀丽隐杆线虫) - - - - - - HPRD, BioGRID 15231747
EEF1A1 CCS-3 | CCS3 | EEF-1 | EEF1A | EF-Tu | EF1A | FLJ25721 | GRAF-1EF | HNGC: 16303 | LENG7 | MGC102687 | MGC131894 | MGC16224 | PTI1 | eEF1A-1 真核翻译延长因子1α1 - - - - - - HPRD, BioGRID 15231747
EIF5A 一个| EIF-5A | EIF5A1 | MGC104255 | MGC99547 | uORF 真核翻译起始因子5 - - - - - - HPRD, BioGRID 15231747
EXOSC10 PM-Scl PM / sci - 100 | | PMSCL | PMSCL2 | RRP6 | Rrp6p | p2 | p3 | p4 外来体组件10 - - - - - - HPRD, BioGRID 15231747
LSM3 SMX4 | USS2 | YLR438C LSM3同族体,U6小核RNA相关(酵母) - - - - - - HPRD, BioGRID 15231747
MOCS3 MGC9252 | UBA4 | dJ914P20.3 钼辅因子合成3 - - - - - - HPRD, BioGRID 15231747
PSMA3 HC8 | MGC12306 | MGC32631 | PSC3 蛋白酶体(prosome macropain)亚基,α型,3 - - - - - - HPRD, BioGRID 15231747
TARDBP ALS10 | TDP-43 焦油DNA结合蛋白 - - - - - - HPRD, BioGRID 15231747
TOLLIP FLJ33531 | IL-1RAcPIP 影响相互作用的蛋白质 2台混合动力 BioGRID 15231747
UPF2 DKFZp434D222 | HUPF2 | KIAA1408 | MGC138834 | MGC138835 | RENT2 | smg-3 UPF2调节器的废话成绩单同族体(酵母) - - - - - - HPRD, BioGRID 15231747


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG RNA降解 59 37 所有SZGR 2.0基因通路
调节REACTOME协会的有条件现金转移支付在生物合成与目标蛋白质 27 15 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME蛋白质折叠 53 30. 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME代谢的蛋白质 518年 242年 所有SZGR 2.0基因通路
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN 463年 290年 所有SZGR 2.0基因通路
金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 1278年 748年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺未分化癌 722年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
GOTZMANN上皮间充质转变DN 206年 136年 所有SZGR 2.0基因通路
ROZANOV MMP14目标了 266年 171年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1目标了 673年 430年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯TP53的目标了 602年 364年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1和TP53的目标 601年 369年 所有SZGR 2.0基因通路
年级结肠癌和直肠癌 285年 167年 所有SZGR 2.0基因通路
蒋介石肝癌子类未经DN 193年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应迟 1137年 655年 所有SZGR 2.0基因通路
DN FEVR CTNNB1目标 553年 343年 所有SZGR 2.0基因通路
RAO受SALL4 227年 149年 所有SZGR 2.0基因通路
PECE乳腺干细胞DN 146年 88年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 203.1 411年 418年 1、m8 hsa - mir - 203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
mir - 539 68年 74年 1 hsa - mir - 539 GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU