基因页：ATF5

Summary？
基因ID 22809
Symbol ATF5
同义词 ATFX | HMFN0395
描述 激活转录因子5
参考 MIM：606398|HGNC：HGNC：790|ENSEMBL：ENSG00000169136|HPRD：05906|Vega：Otthumg00000183065
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.3
Pascal P值 0.154
Sherlock P值 0.45
胎儿β -0.296
主持人 小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
rs16979494 Chrx 14301660 ATF5 22809 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
BCL9 0.97 0.97
BCORL1 0.97 0.97
Mll5 0.96 0.96
Arid1a 0.96 0.97
PHF12 0.96 0.96
PIK3C2B 0.96 0.95
Pogz 0.96 0.96
克雷布 0.96 0.96
EP300 0.95 0.95
C11orf30 0.95 0.96
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.72 -0.90
C5orf53 -0.72 -0.78
S100B -0.72 -0.86
AIFM3 -0.72 -0.77
MT-CO2 -0.71 -0.90
AF347015.27 -0.71 -0.87
FXYD1 -0.71 -0.88
HLA-F -0.70 -0.75
serpinb6 -0.70 -0.77
TSC22D4 -0.70 -0.79

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003700 转录因子活性 IEA -
去：0003702 RNA聚合酶II转录因子activity 塔斯 10373550
去：0003714 转录corepressor activity 塔斯 10373550
GO：0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
GO：0046983 protein dimerization activity IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0006357 调节RNA聚合酶II启动子的转录 塔斯 10373550
GO:0006350 转录 IEA -
去：0006916 抗凋亡 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -
去：0005667 转录因子复合物 IEA -
去：0005737 cytoplasm IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PID PRL信号事件途径 23 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HUTTMANN B CLL POOR SURVIVAL UP 276 187 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang LMO4靶向 372 227 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 All SZGR 2.0 genes in this pathway
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 275 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1签名3 341 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Provenzani转移DN 136 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应表皮DN 508 354 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合目标F DN 33 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TGFB1通过MAPK1 DN进行的Ramjaun凋亡 8 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ETS1和SP100 UP的Yordy倒数调节 25 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JAZAG TGFB1 SIGNALING UP 108 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TSAI RESPONSE TO IONIZING RADIATION 149 101 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向 1037 673 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SUH与ID1和ID2共同表达 19 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭亮氨酸剥夺 142 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭葡萄糖剥夺 48 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chesler Brain QTL Trans 6 5 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Okumura炎症反应LPS 183 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PEART HDAC增殖集群DN 76 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭雷帕霉素反应dn 245 154 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤CD1 45 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
hemin的addya红斑分化 73 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标 88 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 UP 66 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhu CMV全部 120 89 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Weng Portaks全球DN 23 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHU CMV 8 HR UP 47 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tracey对IFNA2 DN的抗性 32 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Weng Por靶向肝脏DN 20 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
磷酸氨基酸剥夺 29 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 1 528 324 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang LSD1目标DN 39 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION DN 281 179 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HANN对BCL2抑制剂DN的抗性 48 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌DN 540 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chung水泡细胞毒性 134 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
对Salirasib的反应 245 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bohn原发性免疫缺陷综合症 47 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindstedt树突状细胞成熟A 67 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利假足趋化趋化性 74 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 All SZGR 2.0 genes in this pathway
gregory合成致死与伊马替尼 145 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
棕熊UVC响应迟到 1137 655 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向 682 433 All SZGR 2.0 genes in this pathway
phong tnf响应不是通过p38 337 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BOSCO TH1细胞毒性模块 114 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-141/200a 730 736 M8 HSA-MIR-141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
hsa-miR-200a uaacacugucuguguguguaaacgaugu