基因页：SCAF8

概括？
基因 22828
象征 SCAF8
同义词 RBM16
描述 与SR相关的CTD相关因子8
参考 MIM：616024|HGNC：HGNC：20959|Ensembl：ENSG00000213079|HPRD：11487|Vega：Otthumg0000000015877
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q25.1-Q25.3
Pascal P值 0.034
胎儿β 0.639
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG02865717 6 155053990 SCAF8 3.01E-8 -0.017 9.23e-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0003723 RNA结合 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 392 398 1a HSA-MIR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-143 40 46 M8 HSA-MIR-143脑 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-153 433 439 1a HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-186 243 249 M8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-223 151 157 M8 HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-361 215 222 1A，M8 HSA-MIR-361脑 uuaucagaaucuccagggguac
mir-381 157 164 1A，M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-448 433 439 1a HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-493-5p 146 152 1a HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu