基因页:ADNP2
概括?
基因 | 22850 |
象征 | ADNP2 |
同义词 | ZNF508 |
描述 | ADNP HONEOBOX 2 |
参考 | HGNC:HGNC:23803|ENSEMBL:ENSG00000101544|HPRD:13822|Vega:Otthumg00000172535 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q23 |
Pascal P值 | 0.035 |
胎儿β | 0.711 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17542055 | CHR7 | 42652803 | ADNP2 | 22850 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ADNP2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PCNX | 0.96 | 0.97 |
AFF4 | 0.95 | 0.98 |
KIAA1632 | 0.95 | 0.96 |
GSK3B | 0.95 | 0.96 |
NR2C2 | 0.95 | 0.96 |
ZFYVE20 | 0.94 | 0.95 |
SLC12A6 | 0.94 | 0.96 |
ABL2 | 0.94 | 0.94 |
RC3H2 | 0.94 | 0.96 |
3月6日 | 0.94 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.71 | -0.79 |
FXYD1 | -0.71 | -0.77 |
MT-CO2 | -0.70 | -0.79 |
higd1b | -0.70 | -0.80 |
ifi27 | -0.69 | -0.77 |
AF347015.21 | -0.68 | -0.82 |
C1orf54 | -0.66 | -0.84 |
AF347015.33 | -0.66 | -0.72 |
AF347015.8 | -0.66 | -0.76 |
mt-cyb | -0.66 | -0.73 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时 | 156 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |