基因页：NTNG1

概括？
基因 22854
象征 NTNG1
同义词 LMNT1
描述 Netrin G1
参考 MIM：608818|HGNC：HGNC：23319|ENSEMBL：ENSG00000162631|HPRD：16389|Vega：Otthumg0000000010965
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p13.3
Pascal P值 0.154
胎儿β -2.486
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG20170831 1 107682818 NTNG1 1.99E-8 -0.023 6.92E-6 DMG：JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9261489 CHR6 30109481 NTNG1 22854 0.15 反式
RS9261519 CHR6 30117100 NTNG1 22854 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
exoc8 0.92 0.93
ZFYVE20 0.92 0.93
kif1b 0.92 0.94
grlf1 0.91 0.92
PCNX 0.91 0.94
thumpd1 0.91 0.93
Smurf1 0.91 0.92
ERCC6 0.91 0.93
OSBP 0.91 0.92
HERC1 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.72 -0.76
AF347015.21 -0.71 -0.80
FXYD1 -0.71 -0.74
MT-CO2 -0.71 -0.76
ifi27 -0.70 -0.74
higd1b -0.70 -0.76
C1orf54 -0.69 -0.81
增强 -0.68 -0.74
Metrn -0.67 -0.74
VAMP5 -0.67 -0.72

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IPI 14595443
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007409 轴突发生 ISS 神经元，轴突，神经突（GO期限：12） -
去：0007399 神经系统的发展 IEA 神经突（GO期限：5） -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
去：0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005578 蛋白质的细胞外基质 IEA -
去：0005886 质膜 IEA -
GO：0046658 锚定在质膜上 ISS -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过nova2拼接 43 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jepsen SMRT目标 33 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM糖蛋白 196 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA地下室膜 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-145 977 983 1a HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-182 754 760 M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-199 975 982 1A，M8 HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc
mir-219 773 779 M8 HSA-MIR-219脑 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-30-5p 907 913 1a HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-539 862 868 M8 HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-9 939 945 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga