基因页:ZBTB1
概括?
基因 | 22890 |
象征 | ZBTB1 |
同义词 | ZNF909 |
描述 | 锌指和包含1的BTB结构域 |
参考 | MIM:616578|HGNC:HGNC:20259|ENSEMBL:ENSG00000126804|HPRD:15688|Vega:Otthumg00000171147 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q23.3 |
Pascal P值 | 3.599E-4 |
DEG P值 | DEG:Maycox_2009:cc_ba10_fold_change = 1.11:cc_ba10_disease_p = 0.0137:hbb_ba9_fold_change = 1.21:hbb_ba9_disease_p = 0.0238 |
胎儿β | 0.288 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Maycox_2009 | 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 | 我们包括了51个基因,其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13674574 | 14 | 64971270 | ZBTB25; ZBTB1 | 1.43E-6 | -0.453 | 0.007 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZBTB1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GTF2IDD1 | 0.96 | 0.94 |
DCHS1 | 0.95 | 0.93 |
CELSR3 | 0.95 | 0.92 |
EHMT1 | 0.95 | 0.95 |
bcl9l | 0.95 | 0.94 |
AD000671.1 | 0.95 | 0.95 |
PHF2 | 0.95 | 0.94 |
Arid1a | 0.95 | 0.92 |
plekhg2 | 0.95 | 0.88 |
BRD1 | 0.95 | 0.94 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.68 | -0.81 |
HLA-F | -0.67 | -0.72 |
FBXO2 | -0.66 | -0.66 |
aldoc | -0.66 | -0.70 |
AIFM3 | -0.66 | -0.71 |
LDHD | -0.65 | -0.64 |
克鲁 | -0.64 | -0.67 |
ACOT13 | -0.64 | -0.76 |
S100B | -0.64 | -0.83 |
LHPP | -0.64 | -0.59 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
刘vmyb的目标 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 | 275 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cheok对高清MTX DN的响应 | 24 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |