基因页：Arhgef15
概括？
| 基因 | 22899 |
| 象征 | Arhgef15 |
| 同义词 | argef15 | e5 | ephexin5 | vsm-rhogef |
| 描述 | Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子15 |
| 参考 | MIM：608504|HGNC：HGNC：15590|ENSEMBL：ENSG00000198844|HPRD：10535|Vega：Otthumg00000108187 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17p13.1 |
| Pascal P值 | 0.196 |
| 胎儿β | 0.018 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arhgef15 | CHR17 | 8222069 | C | t | NM_025014 NM_025014 NM_173728 NM_173728 |
。 p.625a> v 。 p.625a> v |
拼接 错过 拼接 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TSC2 | 0.95 | 0.95 |
| Men1 | 0.95 | 0.96 |
| EDC4 | 0.95 | 0.95 |
| ZNF574 | 0.95 | 0.96 |
| RBM14 | 0.95 | 0.95 |
| PCNXL3 | 0.95 | 0.95 |
| USP19 | 0.94 | 0.94 |
| ATP13A1 | 0.94 | 0.95 |
| C17orf63 | 0.94 | 0.94 |
| ATXN2L | 0.94 | 0.95 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.75 | -0.84 |
| MT-CO2 | -0.74 | -0.85 |
| AF347015.27 | -0.72 | -0.83 |
| AF347015.33 | -0.71 | -0.81 |
| mt-cyb | -0.71 | -0.81 |
| AF347015.8 | -0.70 | -0.83 |
| S100B | -0.70 | -0.81 |
| AF347015.21 | -0.70 | -0.90 |
| C5orf53 | -0.70 | -0.74 |
| COPZ2 | -0.68 | -0.76 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 生物卡塔尔肌球蛋白途径 | 31 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta PAR1途径 | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid rhoa reg途径 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Epha FWDPathway | 34 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 苏胰腺 | 54 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 糖尿病性肾病 | 86 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng IL22信号传导DN | 42 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞DN | 216 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamashita肝癌干细胞向上 | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |