基因页:EPN2
概括?
基因 | 22905 |
象征 | EPN2 |
同义词 | EHB21 |
描述 | Epsin 2 |
参考 | MIM:607263|HGNC:HGNC:18639|Ensembl:ENSG0000000072134|HPRD:06271|Vega:Otthumg00000187034 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p11.2 |
Pascal P值 | 6.085e-6 |
Sherlock P值 | 0.205 |
胎儿β | -0.509 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24028141 | 17 | 19186579 | EPN2 | 2e-6 | 0.338 | 0.008 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EPN2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TTC28 | 0.92 | 0.84 |
SRGAP1 | 0.91 | 0.83 |
DOPEY2 | 0.91 | 0.83 |
sema3a | 0.90 | 0.80 |
C20ORF74 | 0.90 | 0.88 |
Zeb2 | 0.90 | 0.89 |
vash2 | 0.90 | 0.76 |
mllt3 | 0.90 | 0.84 |
ZSCAN2 | 0.90 | 0.80 |
LRCH1 | 0.90 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
pth1r | -0.63 | -0.72 |
C5orf53 | -0.61 | -0.68 |
SLC16A11 | -0.61 | -0.63 |
TNFSF12 | -0.61 | -0.64 |
AIFM3 | -0.61 | -0.67 |
RAMP1 | -0.61 | -0.73 |
AC007405.8 | -0.61 | -0.66 |
ifi27 | -0.60 | -0.80 |
TMEM54 | -0.60 | -0.61 |
HSD17B14 | -0.60 | -0.69 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johansson神经胶质作用是PDGFB | 58 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牛津拉拉目标DN | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应240 HELA | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17P11扩增子 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta EBNA1反相关 | 173 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转换签名 | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |