基因页：MAPRE1

概括？
基因 22919
象征 MAPRE1
同义词 EB1
描述 微管相关蛋白RP/EB家族成员1
参考 MIM：603108|HGNC：HGNC：6890|ENSEMBL：ENSG00000101367|HPRD：04379|Vega：Otthumg0000000032228
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20Q11.1-Q11.23
Pascal P值 0.082
Sherlock P值 0.915
胎儿β 1.474
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.0044

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG27395288 20 31407532 MAPRE1 2.157E-4 0.398 0.036 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
VPS53 0.91 0.92
htt 0.90 0.91
Golga2 0.89 0.90
LARP1 0.88 0.90
mtor 0.88 0.89
TTBK1 0.88 0.90
SPTBN2 0.88 0.89
Clpb 0.88 0.89
Golga3 0.88 0.91
AL117209.1 0.88 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf54 -0.65 -0.72
GNG11 -0.65 -0.67
AF347015.21 -0.65 -0.65
Rhoc -0.62 -0.66
VAMP5 -0.61 -0.59
DBI -0.60 -0.67
SAT1 -0.59 -0.62
Sycp3 -0.59 -0.64
AF347015.31 -0.59 -0.57
C1orf61 -0.59 -0.62

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0008022 蛋白C末端结合 塔斯 7606712
GO：0051010 微管加末端结合 艾达 15631994
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007049 细胞周期 IEA -
去：0007067 有丝分裂 IEA -
去：0008283 细胞增殖 塔斯 7606712
去：0051301 细胞分裂 IEA -
去：0031115 微管聚合的负调节 艾达 11943150
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005794 高尔基体 IEA -
去：0005819 主轴 艾达 11943150
去：0005874 微管 艾达 10773885
去：0005737 细胞质 IEA -
去：0030981 皮质微管细胞骨架 艾达 15631994

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PID NCADHERIN途径 33 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome募集有丝分裂的中心体蛋白和复合物 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
来自有丝分裂中心体NLP的反应组损失 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂M M G1相 172 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂G2 G2 M相 81 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA复制 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组有丝分裂起点 87 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga e2f1靶标由血清诱导 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 176 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chesler Brain QTL顺式 75 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Della对TSA和丁酸酯的反应 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 UP 49 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU遗传毒性损伤4小时 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-10 1621年 1627年 M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-122 35 41 1a HSA-MIR-122A uggagugugacaaugguuuugu
mir-124.1 395 402 1A，M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 395 401 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-129-5p 1493 1499年 1a HSA-MIR-129脑 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-130/301 1132 1138 1a HSA-MIR-130A脑 cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b脑 Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-138 9 15 1a HSA-MIR-138脑 Agcugguuguguugaauc
mir-15/16/195/424/497 958 964 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 135 141 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-182 1490 1496年 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-21 356 362 1a HSA-MIR-21脑 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-216 1333 1339 M8 HSA-MIR-216 uaaucucagcuggcaacugug
mir-221/222 192 198 1a HSA-MIR-221脑 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222脑 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-23 362 369 1A，M8 HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-30-5p 886 892 1a HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-323 361 368 1A，M8 HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
mir-329 1397 1403 1a HSA-MIR-329脑 aacacaccugguaaccucuuu
mir-339 1620年 1626年 M8 HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
mir-370 979 985 M8 HSA-MIR-370脑 gccugggggguggaaccugg
mir-543 1175 1181 1a HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-96 1490 1496年 1a HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc