基因页面:MAPRE3
总结吗?
GeneID | 22924年 |
象征 | MAPRE3 |
同义词 | EB3 | EBF3 | EBF3-S | RP3 |
描述 | 微管相关蛋白RP / EB家庭成员3 |
参考 | MIM: 605788|HGNC: HGNC: 6892|运用:ENSG00000084764|HPRD: 16156|织女:OTTHUMG00000097067 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 2 p23.3-p23.1 |
帕斯卡假定值 | 3.99的军医 |
夏洛克假定值 | 0.91 |
胎儿β | -0.729 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | 结构可塑性 G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg24321774 | 2 | 27193835 | MAPRE3 | 2.054的军医 | -0.248 | 0.035 | DMG: Wockner_2014 |
cg17192247 | 2 | 27194436 | MAPRE3 | 5.476的军医 | 0.395 | 0.049 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs4655259 | chr1 | 214637099 | MAPRE3 | 22924年 | 0.04 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MAPRE3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SHPRH | 0.81 | 0.85 |
MDM2 | 0.81 | 0.84 |
PCM1 | 0.81 | 0.83 |
ZZZ3 | 0.81 | 0.83 |
KIAA0947 | 0.81 | 0.84 |
ZNF549 | 0.81 | 0.82 |
VPS54 | 0.81 | 0.82 |
ZSCAN20 | 0.81 | 0.82 |
NFXL1 | 0.81 | 0.82 |
ZBTB25 | 0.81 | 0.80 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.63 | -0.70 |
MT-CO2 | -0.62 | -0.70 |
IFI27 | -0.61 | -0.69 |
HIGD1B | -0.61 | -0.71 |
FXYD1 | -0.61 | -0.68 |
AF347015.27 | -0.59 | -0.66 |
AF347015.8 | -0.59 | -0.68 |
AF347015.33 | -0.59 | -0.64 |
AF347015.21 | -0.58 | -0.71 |
MT-CYB | -0.58 | -0.65 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
罗德里格斯DCC DN的目标 | 121年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GINESTIER乳腺癌ZNF217放大DN | 335年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN GOZGIT ESR1目标 | 781年 | 465年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BERENJENO改变了RHOA DN | 394年 | 258年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
EBAUER目标PAX3 FOXO1融合起来 | 207年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李PTCH1和SUFU DN的目标 | 83年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
与17个p13 HASLINGER B CLL删除 | 21 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆APC DN的目标 | 366年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RAMASWAMY转移DN | 61年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
麦克朗可卡因奖励5 d | 79年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
海勒HDAC目标被甲基化 | 461年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
贝尔神经胶质瘤干细胞DN | 66年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
60张及目标的人力资源 | 293年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
COULOUARN颞TGFB1签名DN | 138年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
S3 HOSHIDA肝癌子类 | 266年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
IVANOVSKA MIR106B目标 | 90年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
格鲁MIR16目标 | 206年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 | 448年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
皮德森转移由ERBB2同种型7 | 403年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |