概括
基因 22928
象征 sephs2
同义词 SPS2 | SPS2B
描述 硒磷酸合成酶2
参考 MIM:606218|HGNC:HGNC:19686|HPRD:12096|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p11.2
Pascal P值 0.033
Sherlock P值 0.468
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01775

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11199526 Chr10 122510388 sephs2 22928 0.06 反式
RS11199540 Chr10 122530843 sephs2 22928 0.02 反式
RS731616 Chr11 70627158 sephs2 22928 0.05 反式
RS10144869 CHR14 55726091 sephs2 22928 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
WDR47 0.94 0.96
ankmy2 0.93 0.94
rufy3 0.92 0.95
Azin1 0.92 0.94
FYTTD1 0.92 0.95
BNIP3L 0.92 0.95
ACTR3 0.92 0.93
VTA1 0.92 0.94
ATF2 0.91 0.93
KIFAP3 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.77 -0.84
FXYD1 -0.77 -0.86
AF347015.31 -0.76 -0.84
AF347015.33 -0.75 -0.81
HSD17B14 -0.75 -0.80
higd1b -0.75 -0.84
TSC22D4 -0.74 -0.81
ifi27 -0.74 -0.84
mt-cyb -0.74 -0.81
AIFM3 -0.74 -0.78

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003824 催化活性 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004756 硒,水二基酶活性 IEA -
去:0004756 硒,水二基酶活性 nas 8986768
去:0008430 硒结合 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016260 硒代生物合成过程 nas 8986768
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005575 cellular_component nd -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG Selenoamino酸代谢 26 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红细胞侵蚀 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水DN抑制 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化克拉斯 126 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP UP 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A DN的缺氧总缺氧 103 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肯尼CTNNB1靶向 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝克莫昔芬的抵抗 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI葡萄糖剥夺 60 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Myc Up监管 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-133 403 409 1a HSA-MIR-133A uugguccccuucaaccagcugu
HSA-MIR-133B uguguccccuucaaccagcua
mir-150 610 616 1a HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-339 325 331 1a HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca