基因页:sephs2
概括?
基因 | 22928 |
象征 | sephs2 |
同义词 | SPS2 | SPS2B |
描述 | 硒磷酸合成酶2 |
参考 | MIM:606218|HGNC:HGNC:19686|HPRD:12096| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p11.2 |
Pascal P值 | 0.033 |
Sherlock P值 | 0.468 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11199526 | Chr10 | 122510388 | sephs2 | 22928 | 0.06 | 反式 | ||
RS11199540 | Chr10 | 122530843 | sephs2 | 22928 | 0.02 | 反式 | ||
RS731616 | Chr11 | 70627158 | sephs2 | 22928 | 0.05 | 反式 | ||
RS10144869 | CHR14 | 55726091 | sephs2 | 22928 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
WDR47 | 0.94 | 0.96 |
ankmy2 | 0.93 | 0.94 |
rufy3 | 0.92 | 0.95 |
Azin1 | 0.92 | 0.94 |
FYTTD1 | 0.92 | 0.95 |
BNIP3L | 0.92 | 0.95 |
ACTR3 | 0.92 | 0.93 |
VTA1 | 0.92 | 0.94 |
ATF2 | 0.91 | 0.93 |
KIFAP3 | 0.91 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.77 | -0.84 |
FXYD1 | -0.77 | -0.86 |
AF347015.31 | -0.76 | -0.84 |
AF347015.33 | -0.75 | -0.81 |
HSD17B14 | -0.75 | -0.80 |
higd1b | -0.75 | -0.84 |
TSC22D4 | -0.74 | -0.81 |
ifi27 | -0.74 | -0.84 |
mt-cyb | -0.74 | -0.81 |
AIFM3 | -0.74 | -0.78 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003824 | 催化活性 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004756 | 硒,水二基酶活性 | IEA | - | |
去:0004756 | 硒,水二基酶活性 | nas | 8986768 | |
去:0008430 | 硒结合 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016260 | 硒代生物合成过程 | nas | 8986768 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005575 | cellular_component | nd | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG Selenoamino酸代谢 | 26 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红细胞侵蚀 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Puiffe入侵被腹水DN抑制 | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化克拉斯 | 126 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化cdc25 | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP UP | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3和HIF1A DN的缺氧总缺氧 | 103 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肯尼CTNNB1靶向 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝克莫昔芬的抵抗 | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 | 182 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
welcsh brca1靶向 | 198 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI葡萄糖剥夺 | 60 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Myc Up监管 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-133 | 403 | 409 | 1a | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
mir-150 | 610 | 616 | 1a | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
mir-339 | 325 | 331 | 1a | HSA-MIR-339 | ucccuccuccaggagcuca |