概括
基因 22934
象征 RPIA
同义词 rpi | rpiad
描述 核糖5-磷酸异构酶A
参考 MIM:180430|HGNC:HGNC:10297|ENSEMBL:ENSG00000153574|HPRD:01589|Vega:Otthumg00000130333
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P11.2
Pascal P值 0.132
Sherlock P值 8.849e-6
胎儿β 0.103
DMG 1(#研究)
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0004

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13293721 2 88990738 RPIA 1.19e-9 -0.014 1.28e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MTMR12 0.90 0.91
Rapgef2 0.89 0.89
BTBD9 0.87 0.87
trappc10 0.87 0.86
magi2 0.87 0.88
USP46 0.86 0.87
DOCK3 0.86 0.86
arnt2 0.86 0.86
htt 0.86 0.86
phlpp2 0.86 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.57 -0.50
DBI -0.57 -0.61
C1orf54 -0.56 -0.58
GNG11 -0.55 -0.54
C1orf61 -0.54 -0.59
IL32 -0.53 -0.49
Rhoc -0.53 -0.55
AC098691.2 -0.52 -0.52
Rab34 -0.52 -0.54
Sycp3 -0.52 -0.53

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004751 核糖5-磷酸异构酶活性 经验 14988808
去:0004751 核糖5-磷酸异构酶活性 IEA -
去:0004751 核糖5-磷酸异构酶活性 nas 7758956
GO:0016853 异构酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0009052 戊糖 - 磷酸分流,非氧化分支 IEA -
去:0009052 戊糖 - 磷酸分流,非氧化分支 nas -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 14988808
去:0005622 细胞内 nas -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG戊糖磷酸盐途径 27 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2的反应 146 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AKL HTLV1感染DN 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶标和血清反应DN 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Mycn扩增靶向 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT网络 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA中心网络 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci侵入性癌导管与小叶 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 176 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 236 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuhmacher MYC的目标 80 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时 156 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射2G后的生存率不佳 171 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRCA1的Pujana乳腺癌突变 56 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 426 432 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 77 83 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-129-5p 279 285 1a HSA-MIR-129 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu