基因页：ELL2

概括?
基因ID 22936
Symbol ELL2
同义词 -
描述 elongation factor for RNA polymerase II 2
参考 MIM:601874|HGNC：HGNC：17064|Ensembl:ENSG00000118985|HPRD:11798|Vega:OTTHUMG00000122085
基因type protein-coding
地图位置 5q15
Pascal P值 0.16
Sherlock P值 0.201
Fetal beta -1.762
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
Expression 基因表达的荟萃分析 P价值：1.355

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg16998950 5 95252658 ELL2 4.206E-4 -0.622 0.045 DMG:Wockner_2014


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
KIAA0355 0.93 0.93
ZFYVE26 0.93 0.94
KIAA0892 0.92 0.94
ZZEF1 0.92 0.94
KIAA0467 0.92 0.92
DHX33 0.92 0.92
BAZ2A 0.92 0.93
BICD2 0.92 0.94
GPATCH8 0.91 0.92
ATXN7 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
AF347015.31 -0.69 -0.76
AF347015.21 -0.68 -0.82
MT-CO2 -0.67 -0.74
AF347015.27 -0.65 -0.71
C1orf54 -0.64 -0.80
higd1b -0.64 -0.72
FXYD1 -0.63 -0.69
IFI27 -0.63 -0.67
AF347015.33 -0.63 -0.67
AF347015.8 -0.63 -0.71

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0003702 RNA polymerase II transcription factor activity 塔斯 9108030
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006355 regulation of transcription, DNA-dependent IEA -
GO:0006368 RNA聚合酶II启动子的RNA伸长率 塔斯 9108030
GO:0006350 transcription IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005634 核 IEA -
去：0008023 转录伸长因子复合物 塔斯 9108030

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
THUM SYSTOLIC HEART FAILURE DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAL LEUKEMIC STEM CELL DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER GRADES 1 2 UP 137 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LANDIS BREAST CANCER PROGRESSION UP 44 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LANDIS ERBB2 BREAST TUMORS 324 UP 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化hemgn 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLOSSER SERUM RESPONSE UP 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
沙诺田顺铂耐药性DN 51 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS FETAL LIVER DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 240 HELA 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT SERUM RESPONSE 60 MCF10A 57 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEORGES TARGETS OF MIR192 AND MIR215 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 78 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim生发中心T助手DN 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素的反应 86 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nguyen Notch1靶向DN 86 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSE HYPOXIA UP 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML FAB MARKERS 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C2 54 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAYO AGING MUSCLE DN 123 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG HYPOXIA NORMAL 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DURCHDEWALD SKIN CARCINOGENESIS DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE UP 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE UP 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼的抵抗 81 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB UP 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 MULTIPLE MYELOMA PROGRAM 36 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN PLASMA CELL VS MATURE B LYMPHOCYTE 67 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN ACTIVATED B LYMPHOCYTE 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN ACTIVATED DENDRITIC CELL 65 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未经注释 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG RECURRENT LIVER CANCER DN 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UZONYI RESPONSE TO LEUKOTRIENE AND THROMBIN 37 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORN ADENOVIRUS INFECTION 12HR UP 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORN ADENOVIRUS INFECTION 24HR DN 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORN ADENOVIRUS INFECTION 32HR DN 39 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORN ADENOVIRUS INFECTION 48HR DN 40 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU EZH2 TARGETS DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS UP 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS DN 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANGOLKAR H2AFY TARGETS DN 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TORCHIA TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION DN 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 4 110 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO ALLERGEN INDUCED TH2 ASSOCIATED MODULE 151 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DURAND STROMA S UP 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-124.1 454 461 1A,m8 hsa-miR-124a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
hsa-miR-124a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 633 639 1A HSA-MIR-506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa-miR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
HSA-MIR-506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa-miR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 1195 1201 1A HSA-MIR-128A UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
HSA-MIR-128B UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
mir-144 1193 1199 m8 hsa-miR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-153 1091 1097 1A hsa-miR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-155 1390 1396 m8 hsa-miR-155 UUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGG
mir-182 1422 1429 1A,m8 hsa-miR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
mir-19 481 488 1A,m8 hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b ugugcaaauccaugcaaaacuga
miR-203.1 939 945 1A HSA-MIR-203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
HSA-MIR-203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
miR-204/211 1383 1390 1A,m8 HSA-MIR-204脑 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
miR-218 1212 1218 1A HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-23 21 27 1A hsa-miR-23a脑 aucacauugccagggauucc
hsa-miR-23b脑 aucacauugccagggauuacc
mir-27 1195 1201 m8 hsa-miR-27a脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
hsa-miR-27b脑 uucacaguggcuaaguucugc
miR-30-5p 1397 1404 1A,m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
miR-320 956 963 1A,m8 HSA-MIR-320 AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA
miR-410 1056 1062 1A HSA-MIR-410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
miR-448 1090 1097 1A,m8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-490 835 841 1A hsa-miR-490 CAACCUGGAGGACUCCAUGCUG
miR-96 1423 1429 1A hsa-miR-96脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC