基因页：scap
概括？
| 基因 | 22937 |
| 象征 | scap |
| 同义词 | - |
| 描述 | SREBF伴侣 |
| 参考 | MIM：601510|HGNC：HGNC：30634|Ensembl：ENSG00000114650|HPRD：03300|Vega：Otthumg00000125539 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P21.31 |
| Pascal P值 | 0.169 |
| Sherlock P值 | 0.083 |
| 胎儿β | -0.423 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 皮质 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG21581415 | 3 | 47460784 | scap | 2.38e-5 | 0.006 | 0.067 | DMG：Montano_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4864466 | CHR4 | 54403975 | scap | 22937 | 0.12 | 反式 | ||
| RS6835548 | CHR4 | 140644143 | scap | 22937 | 0.18 | 反式 | ||
| RS13094438 | 3 | 47277885 | scap | ENSG00000114650.14 | 4.515E-6 | 0.03 | 240731 | gtex_brain_ba24 |
| RS11130123 | 3 | 47285912 | scap | ENSG00000114650.14 | 4.589E-6 | 0.03 | 232704 | gtex_brain_ba24 |
| RS11710013 | 3 | 47296921 | scap | ENSG00000114650.14 | 4.589E-6 | 0.03 | 221695 | gtex_brain_ba24 |
| RS807936 | 3 | 47322496 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.392E-6 | 0.03 | 196120 | gtex_brain_ba24 |
| RS1638676 | 3 | 47327651 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.392E-6 | 0.03 | 190965 | gtex_brain_ba24 |
| RS13072802 | 3 | 47346415 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.384e-6 | 0.03 | 172201 | gtex_brain_ba24 |
| RS807932 | 3 | 47354241 | scap | ENSG00000114650.14 | 4.963E-6 | 0.03 | 164375 | gtex_brain_ba24 |
| RS295428 | 3 | 47359262 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.899E-6 | 0.03 | 159354 | gtex_brain_ba24 |
| RS295461 | 3 | 47368010 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.388e-6 | 0.03 | 150606 | gtex_brain_ba24 |
| RS295449 | 3 | 47375955 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.283E-6 | 0.03 | 142661 | gtex_brain_ba24 |
| RS295458 | 3 | 47385585 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.392E-6 | 0.03 | 133031 | gtex_brain_ba24 |
| RS807810 | 3 | 47403892 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.398E-6 | 0.03 | 114724 | gtex_brain_ba24 |
| RS369122584 | 3 | 47431869 | scap | ENSG00000114650.14 | 3.008e-6 | 0.03 | 86747 | gtex_brain_ba24 |
| RS4241548 | 3 | 47439231 | scap | ENSG00000114650.14 | 6.412E-6 | 0.03 | 79385 | gtex_brain_ba24 |
| RS4858805 | 3 | 47444281 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.379E-6 | 0.03 | 74335 | gtex_brain_ba24 |
| RS12487736 | 3 | 47459679 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.599E-6 | 0.03 | 58937 | gtex_brain_ba24 |
| RS4858894 | 3 | 47484953 | scap | ENSG00000114650.14 | 5.505E-6 | 0.03 | 33663 | gtex_brain_ba24 |
| RS12492433 | 3 | 47515557 | scap | ENSG00000114650.14 | 3.641E-6 | 0.03 | 3059 | gtex_brain_ba24 |
| RS199740248 | 3 | 47517772 | scap | ENSG00000114650.14 | 4.283E-6 | 0.03 | 844 | gtex_brain_ba24 |
| RS11708770 | 3 | 47517774 | scap | ENSG00000114650.14 | 6.491E-6 | 0.03 | 842 | gtex_brain_ba24 |
| RS11914932 | 3 | 47558184 | scap | ENSG00000114650.14 | 3.696E-6 | 0.03 | -39568 | gtex_brain_ba24 |
| RS75815271 | 3 | 48405661 | scap | ENSG00000114650.14 | 2.204E-6 | 0.03 | -887045 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0051082 | 展开的蛋白质结合 | nas | 11726962 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008202 | 类固醇代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0008203 | 胆固醇代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0006994 | 固醇调节元素结合蛋白靶基因转录的正调节参与固醇耗竭反应 | 小鬼 | 11726962 | |
| 去：0006629 | 脂质代谢过程 | IEA | - | |
| GO：0019217 | 调节脂肪酸代谢过程 | IEA | - | |
| GO：0045541 | 胆固醇生物合成过程的阴性调节 | nas | 11969205 | |
| GO：0045716 | 低密度脂蛋白受体生物合成过程的阳性调节 | nas | 11726974 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
| 去：0005794 | 高尔基体 | nas | 11726962 | |
| 去：0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
| 去：0005783 | 内质网 | nas | 11726962 | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | nas | 11726962 | |
| GO：0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| SA级联级联 | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIN APC目标 | 77 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller AML融合的共同靶标 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |