概括
基因 22944
象征 亲属
同义词 btcd | kin17 | rts2
描述 KIN17 DNA和RNA结合蛋白
参考 MIM:601720|HGNC:HGNC:6327|ENSEMBL:ENSG00000151657|HPRD:03425|Vega:Otthumg0000000017634
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10p14
Pascal P值 0.888
Sherlock P值 0.823
胎儿β 0.711
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02075054 10 7829911 亲属 5.64e-8 -0.006 1.45e-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7908616 Chr10 6941671 亲属 22944 0.12 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
sash1 0.90 0.88
FYCO1 0.90 0.85
KCNJ10 0.89 0.89
ITPKB 0.89 0.90
CGNL1 0.88 0.82
ATP13A4 0.88 0.81
TPCN1 0.88 0.87
ATP1A2 0.87 0.88
CPT1A 0.87 0.83
ZCCHC24 0.87 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Med19 -0.60 -0.63
polb -0.58 -0.65
NR2C2AP -0.56 -0.62
ALKBH2 -0.55 -0.63
Commd3 -0.55 -0.63
FRG1 -0.55 -0.65
ING4 -0.55 -0.57
STMN1 -0.54 -0.55
DCTPP1 -0.54 -0.58
SCNM1 -0.54 -0.60

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌6小时DN 167 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roversi Glioma副本编号DN 54 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYCN扩增靶向DN 103 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung可卡因奖励4WK 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼(Hoffmann 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应中间 98 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因