基因页:dip2c
概括?
基因 | 22982 |
象征 | dip2c |
同义词 | KIAA0934 |
描述 | 迪斯科相互作用蛋白2同源物C |
参考 | MIM:611380|HGNC:HGNC:29150|ENSEMBL:ENSG00000151240|HPRD:17200|Vega:Otthumg0000000017532 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10p15.3 |
Pascal P值 | 0.002 |
Sherlock P值 | 0.104 |
胎儿β | 0.983 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 | 8 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 8 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
dip2c | Chr10 | 387255 | G | 一个 | NM_014974 | 。 | 沉默的 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03459202 | 10 | 676740 | dip2c | 3.57E-4 | -0.003 | 0.193 | DMG:Montano_2016 |
CG26406407 | 10 | 438229 | dip2c | 4.31E-5 | 0.358 | 0.021 | DMG:Wockner_2014 |
CG15713378 | 10 | 709839 | dip2c; c10orf108 | 5.09e-5 | -0.688 | 0.022 | DMG:Wockner_2014 |
CG08324703 | 10 | 679514 | dip2c | 1.354E-4 | 0.683 | 0.031 | DMG:Wockner_2014 |
CG27421267 | 10 | 530836 | dip2c | 2.048e-4 | 0.579 | 0.035 | DMG:Wockner_2014 |
CG11468148 | 10 | 670815 | dip2c | 2.851E-4 | -0.42 | 0.039 | DMG:Wockner_2014 |
CG06571559 | 10 | 670787 | dip2c | 4.527E-4 | -0.321 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
CG25297146 | 10 | 679399 | dip2c | 5.028e-4 | 0.603 | 0.047 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1578978 | CHR8 | 118196802 | dip2c | 22982 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DIP2C_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bilban b cll lpl up | 63 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时DN | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射2G后的生存率不佳 | 171 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |