基因页：PDCD11

概括？
基因 22984
象征 PDCD11
同义词 ALG-4 | ALG4 | NFBP | RRP5
描述 程序性细胞死亡11
参考 MIM：612333|HGNC：HGNC：13408|ENSEMBL：ENSG00000148843|HPRD：18752|Vega：Otthumg0000000018988
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q24.33
Pascal P值 0.002
Sherlock P值 0.184
胎儿β 0.752
DMG 1（＃研究）
支持 COMPOSITESET
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
LK：是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
PDCD11 Chr10 105184868 G 一种 NM_014976 p.964r> h 错过 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG04165840 10 105156204 USMG5; PDCD11 4.025e-4 -0.183 0.044 DMG：Wockner_2014
CG26719024 10 105156444 PDCD11 8.57E-10 -0.014 1.08E-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SMAP2 0.93 0.90
SGIP1 0.92 0.92
FBXO34 0.92 0.89
CNKSR2 0.91 0.89
MAPK9 0.91 0.89
park2 0.90 0.88
CAP2 0.90 0.89
NMT1 0.90 0.88
FAM179B 0.90 0.88
CDC40 0.89 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.51 -0.35
Rab34 -0.50 -0.55
AF347015.18 -0.48 -0.32
C1orf61 -0.48 -0.53
DBI -0.47 -0.51
AP002478.3 -0.47 -0.45
C1orf54 -0.47 -0.45
Rhoc -0.47 -0.53
GNG11 -0.46 -0.41
IL32 -0.46 -0.40

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
冷吉非替尼抵抗 85 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lau凋亡CDKN2A UP 55 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级转移DN 45 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC靶向 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移DN 53 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因