概括
基因 22989
象征 myh15
同义词 -
描述 肌球蛋白,重链15
参考 MIM:609929|HGNC:HGNC:31073|ENSEMBL:ENSG00000144821|Vega:Otthumg00000159226
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q13.13
Pascal P值 0.228
胎儿β -0.539
DMG 1(#研究)
主持人 伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.04359
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.04047

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01135165 3 108191083 myh15 2.636E-4 0.421 0.038 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SSRP1 0.95 0.94
RPIA 0.94 0.93
ewsr1 0.94 0.93
hnrnph1 0.93 0.94
Tra2a 0.93 0.92
hnrnpul1 0.93 0.91
标记3 0.93 0.93
tra2b 0.93 0.93
RAF1 0.93 0.93
PPP4R1 0.93 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.79 -0.79
AF347015.31 -0.79 -0.91
AF347015.27 -0.78 -0.89
MT-CO2 -0.77 -0.90
AIFM3 -0.77 -0.77
AF347015.33 -0.76 -0.88
TSC22D4 -0.76 -0.81
aldoc -0.75 -0.73
mt-cyb -0.75 -0.89
C5orf53 -0.75 -0.73

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003779 肌动蛋白结合 IEA -
去:0003774 运动活动 IEA -
去:0005516 钙调蛋白结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006941 条纹肌肉收缩 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005863 条纹肌肉厚丝 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
GO:0016459 肌球蛋白复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg thright连接点 134 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG病毒心肌炎 73 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔 105 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因