基因页:myh15
概括?
基因 | 22989 |
象征 | myh15 |
同义词 | - |
描述 | 肌球蛋白,重链15 |
参考 | MIM:609929|HGNC:HGNC:31073|ENSEMBL:ENSG00000144821|Vega:Otthumg00000159226 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q13.13 |
Pascal P值 | 0.228 |
胎儿β | -0.539 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 伏隔核基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.04359 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.04047 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01135165 | 3 | 108191083 | myh15 | 2.636E-4 | 0.421 | 0.038 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MYH15_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SSRP1 | 0.95 | 0.94 |
RPIA | 0.94 | 0.93 |
ewsr1 | 0.94 | 0.93 |
hnrnph1 | 0.93 | 0.94 |
Tra2a | 0.93 | 0.92 |
hnrnpul1 | 0.93 | 0.91 |
标记3 | 0.93 | 0.93 |
tra2b | 0.93 | 0.93 |
RAF1 | 0.93 | 0.93 |
PPP4R1 | 0.93 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.79 | -0.79 |
AF347015.31 | -0.79 | -0.91 |
AF347015.27 | -0.78 | -0.89 |
MT-CO2 | -0.77 | -0.90 |
AIFM3 | -0.77 | -0.77 |
AF347015.33 | -0.76 | -0.88 |
TSC22D4 | -0.76 | -0.81 |
aldoc | -0.75 | -0.73 |
mt-cyb | -0.75 | -0.89 |
C5orf53 | -0.75 | -0.73 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
去:0003774 | 运动活动 | IEA | - | |
去:0005516 | 钙调蛋白结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006941 | 条纹肌肉收缩 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005863 | 条纹肌肉厚丝 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
GO:0016459 | 肌球蛋白复合物 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG病毒心肌炎 | 73 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔 | 105 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |