基因页:FOXI1
概括?
基因 | 2299 |
象征 | FOXI1 |
同义词 | fkh10 | fkhl10 | freac-6 | freac6 | hfh-3 | hfh3 |
描述 | 叉子盒I1 |
参考 | MIM:601093|HGNC:HGNC:3815|ENSEMBL:ENSG00000168269|HPRD:03057|Vega:Otthumg00000130436 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q34 |
Pascal P值 | 0.012 |
胎儿β | 0.316 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.0276 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF397 | 0.40 | 0.40 |
MDN1 | 0.40 | 0.36 |
CHD2 | 0.40 | 0.39 |
KIAA1530 | 0.39 | 0.39 |
ATM | 0.39 | 0.36 |
MACF1 | 0.39 | 0.40 |
宁 | 0.38 | 0.41 |
tnrc6a | 0.38 | 0.39 |
ZC3H13 | 0.38 | 0.40 |
gigyf2 | 0.38 | 0.40 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1orf122 | -0.29 | -0.33 |
GCAT | -0.28 | -0.32 |
COX5B | -0.28 | -0.32 |
nenf | -0.27 | -0.34 |
NUDT22 | -0.27 | -0.31 |
Shisa4 | -0.27 | -0.33 |
AC018755.9 | -0.27 | -0.28 |
增强 | -0.27 | -0.33 |
ITM2A | -0.27 | -0.29 |
FAM108A4 | -0.27 | -0.29 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 7957066 | |
去:0008301 | DNA弯曲活性 | nas | - | |
GO:0016563 | 转录激活剂活性 | IEA | - | |
GO:0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
去:0007605 | 声音的感官感知 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | nas | 7957066 | |
GO:0042472 | 内耳形态发生 | IEA | - | |
GO:0045893 | 转录,DNA依赖性的阳性调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | nas | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
su唾液腺 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lim乳腺腔祖先 | 58 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |