概括
基因 2299
象征 FOXI1
同义词 fkh10 | fkhl10 | freac-6 | freac6 | hfh-3 | hfh3
描述 叉子盒I1
参考 MIM:601093|HGNC:HGNC:3815|ENSEMBL:ENSG00000168269|HPRD:03057|Vega:Otthumg00000130436
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q34
Pascal P值 0.012
胎儿β 0.316

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.0276

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF397 0.40 0.40
MDN1 0.40 0.36
CHD2 0.40 0.39
KIAA1530 0.39 0.39
ATM 0.39 0.36
MACF1 0.39 0.40
0.38 0.41
tnrc6a 0.38 0.39
ZC3H13 0.38 0.40
gigyf2 0.38 0.40
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf122 -0.29 -0.33
GCAT -0.28 -0.32
COX5B -0.28 -0.32
nenf -0.27 -0.34
NUDT22 -0.27 -0.31
Shisa4 -0.27 -0.33
AC018755.9 -0.27 -0.28
增强 -0.27 -0.33
ITM2A -0.27 -0.29
FAM108A4 -0.27 -0.29

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 塔斯 7957066
去:0008301 DNA弯曲活性 nas -
GO:0016563 转录激活剂活性 IEA -
GO:0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006350 转录 IEA -
去:0007605 声音的感官感知 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 nas 7957066
GO:0042472 内耳形态发生 IEA -
GO:0045893 转录,DNA依赖性的阳性调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 nas -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
su唾液腺 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔祖先 58 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因