基因页:CEP152
概括?
基因 | 22995 |
象征 | CEP152 |
同义词 | MCPH4 | MCPH9 | SCKL5 |
描述 | 中心蛋白152KDA |
参考 | MIM:613529|HGNC:HGNC:29298|Ensembl:ENSG00000103995|HPRD:16778|Vega:Otthumg00000172219 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q21.1 |
Pascal P值 | 0.534 |
胎儿β | 1.545 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21041764 | 15 | 49103369 | CEP152 | 1.04E-8 | -0.015 | 4.49e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CEP152_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
lbr | 0.93 | 0.88 |
Smarcd1 | 0.92 | 0.93 |
PAXIP1 | 0.92 | 0.92 |
CASP2 | 0.91 | 0.93 |
ZCCHC11 | 0.91 | 0.92 |
zik1 | 0.91 | 0.91 |
SCML2 | 0.91 | 0.88 |
芽13 | 0.90 | 0.89 |
CDK5RAP2 | 0.90 | 0.87 |
LMNB1 | 0.90 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AIFM3 | -0.67 | -0.79 |
C5orf53 | -0.67 | -0.75 |
aldoc | -0.67 | -0.73 |
FBXO2 | -0.67 | -0.67 |
HLA-F | -0.67 | -0.76 |
pth1r | -0.67 | -0.74 |
LHPP | -0.66 | -0.62 |
LDHD | -0.66 | -0.68 |
S100B | -0.65 | -0.83 |
克鲁 | -0.64 | -0.70 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标1向上 | 140 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的moreaux b淋巴细胞成熟 | 73 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
苏胰腺 | 54 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 | 193 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |