概括
基因 23
象征 ABCF1
同义词 ABC27 | ABC50
描述 ATP绑定盒子亚家族F构件1
参考 MIM:603429|HGNC:HGNC:70|Ensembl:ENSG00000204574|HPRD:09139|Vega:Otthumg00000031094
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.33
Pascal P值 1.588e-14
Sherlock P值 0.634
胎儿β 0.512
主持人 尾状基底神经节
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 塔斯 9790762
去:0008135 翻译因子活性,核酸结合 塔斯 9790762
GO:0016887 ATPase活性 IEA -
GO:0042626 ATPase活性,与物质的跨膜运动耦合 塔斯 9790762
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006412 翻译 塔斯 9790762
去:0006954 炎症反应 塔斯 9790762

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Grasemann视网膜细胞瘤,具有6p扩增 14 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期16小时 40 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因