基因页:ABCF1
概括?
基因 | 23 |
象征 | ABCF1 |
同义词 | ABC27 | ABC50 |
描述 | ATP绑定盒子亚家族F构件1 |
参考 | MIM:603429|HGNC:HGNC:70|Ensembl:ENSG00000204574|HPRD:09139|Vega:Otthumg00000031094 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p21.33 |
Pascal P值 | 1.588e-14 |
Sherlock P值 | 0.634 |
胎儿β | 0.512 |
主持人 | 尾状基底神经节 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ABCF1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | 塔斯 | 9790762 | |
去:0008135 | 翻译因子活性,核酸结合 | 塔斯 | 9790762 | |
GO:0016887 | ATPase活性 | IEA | - | |
GO:0042626 | ATPase活性,与物质的跨膜运动耦合 | 塔斯 | 9790762 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006412 | 翻译 | 塔斯 | 9790762 | |
去:0006954 | 炎症反应 | 塔斯 | 9790762 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Grasemann视网膜细胞瘤,具有6p扩增 | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成年时期16小时 | 40 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |