概括
基因 23005
象征 MAPKBP1
同义词 JNKBP-1 | JNKBP1
描述 有丝分裂原激活的蛋白激酶结合蛋白1
参考 MIM:616786|HGNC:HGNC:29536|ENSEMBL:ENSG00000137802|HPRD:17465|Vega:Otthumg00000160227
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q15.1
Pascal P值 0.672
Sherlock P值 0.297
胎儿β 0.929
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键字的同时存在:精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 MAPKBP1 23005 1.478e-16 反式
RS3845734 CHR2 171125572 MAPKBP1 23005 0.01 反式
RS7584986 CHR2 184111432 MAPKBP1 23005 2.881E-5 反式
RS2183142 CHR4 159232695 MAPKBP1 23005 0.07 反式
RS170776 CHR4 173276735 MAPKBP1 23005 0.13 反式
RS1396222 CHR4 173279496 MAPKBP1 23005 0.13 反式
RS335993 CHR4 173321789 MAPKBP1 23005 0.18 反式
RS335980 CHR4 173329784 MAPKBP1 23005 0.11 反式
RS335982 CHR4 173330945 MAPKBP1 23005 0.15 反式
RS336016 CHR4 173366576 MAPKBP1 23005 0.17 反式
RS337984 CHR4 173411662 MAPKBP1 23005 0.09 反式
RS17762315 CHR5 76807576 MAPKBP1 23005 0.02 反式
RS9461864 CHR6 33481468 MAPKBP1 23005 0.01 反式
RS7787830 CHR7 98797019 MAPKBP1 23005 0.03 反式
RS3118341 Chr9 25185518 MAPKBP1 23005 0.16 反式
RS9406868 Chr9 25223372 MAPKBP1 23005 0.16 反式
RS11139334 Chr9 84209393 MAPKBP1 23005 0.17 反式
RS16955618 CHR15 29937543 MAPKBP1 23005 2.07e-19 反式
RS11873184 CHR18 1584081 MAPKBP1 23005 0.05 反式
RS1041786 CHR21 22617710 MAPKBP1 23005 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
WNK1 0.92 0.91
CLN8 0.88 0.89
SPTLC2 0.87 0.88
KIAA1147 0.85 0.88
USP54 0.85 0.82
Dennd5a 0.84 0.87
dst 0.84 0.83
BBX 0.84 0.81
AFF1 0.84 0.82
FAM55C 0.83 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ST20 -0.50 -0.57
C1orf61 -0.45 -0.50
IL32 -0.44 -0.52
PFDN5 -0.44 -0.45
timm8b -0.43 -0.45
C8orf59 -0.42 -0.45
C1orf54 -0.42 -0.50
Sycp3 -0.42 -0.51
AF347015.21 -0.41 -0.44
SERF2 -0.41 -0.45

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME1的近代结肠癌HCP 26 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脑DN中的乳腺癌复发 85 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GU PDEF目标 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 157 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 145 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因