基因页:MAPKBP1
概括?
基因 | 23005 |
象征 | MAPKBP1 |
同义词 | JNKBP-1 | JNKBP1 |
描述 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶结合蛋白1 |
参考 | MIM:616786|HGNC:HGNC:29536|ENSEMBL:ENSG00000137802|HPRD:17465|Vega:Otthumg00000160227 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q15.1 |
Pascal P值 | 0.672 |
Sherlock P值 | 0.297 |
胎儿β | 0.929 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键字的同时存在:精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | MAPKBP1 | 23005 | 1.478e-16 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | MAPKBP1 | 23005 | 0.01 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | MAPKBP1 | 23005 | 2.881E-5 | 反式 | ||
RS2183142 | CHR4 | 159232695 | MAPKBP1 | 23005 | 0.07 | 反式 | ||
RS170776 | CHR4 | 173276735 | MAPKBP1 | 23005 | 0.13 | 反式 | ||
RS1396222 | CHR4 | 173279496 | MAPKBP1 | 23005 | 0.13 | 反式 | ||
RS335993 | CHR4 | 173321789 | MAPKBP1 | 23005 | 0.18 | 反式 | ||
RS335980 | CHR4 | 173329784 | MAPKBP1 | 23005 | 0.11 | 反式 | ||
RS335982 | CHR4 | 173330945 | MAPKBP1 | 23005 | 0.15 | 反式 | ||
RS336016 | CHR4 | 173366576 | MAPKBP1 | 23005 | 0.17 | 反式 | ||
RS337984 | CHR4 | 173411662 | MAPKBP1 | 23005 | 0.09 | 反式 | ||
RS17762315 | CHR5 | 76807576 | MAPKBP1 | 23005 | 0.02 | 反式 | ||
RS9461864 | CHR6 | 33481468 | MAPKBP1 | 23005 | 0.01 | 反式 | ||
RS7787830 | CHR7 | 98797019 | MAPKBP1 | 23005 | 0.03 | 反式 | ||
RS3118341 | Chr9 | 25185518 | MAPKBP1 | 23005 | 0.16 | 反式 | ||
RS9406868 | Chr9 | 25223372 | MAPKBP1 | 23005 | 0.16 | 反式 | ||
RS11139334 | Chr9 | 84209393 | MAPKBP1 | 23005 | 0.17 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | MAPKBP1 | 23005 | 2.07e-19 | 反式 | ||
RS11873184 | CHR18 | 1584081 | MAPKBP1 | 23005 | 0.05 | 反式 | ||
RS1041786 | CHR21 | 22617710 | MAPKBP1 | 23005 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MAPKBP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
WNK1 | 0.92 | 0.91 |
CLN8 | 0.88 | 0.89 |
SPTLC2 | 0.87 | 0.88 |
KIAA1147 | 0.85 | 0.88 |
USP54 | 0.85 | 0.82 |
Dennd5a | 0.84 | 0.87 |
dst | 0.84 | 0.83 |
BBX | 0.84 | 0.81 |
AFF1 | 0.84 | 0.82 |
FAM55C | 0.83 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ST20 | -0.50 | -0.57 |
C1orf61 | -0.45 | -0.50 |
IL32 | -0.44 | -0.52 |
PFDN5 | -0.44 | -0.45 |
timm8b | -0.43 | -0.45 |
C8orf59 | -0.42 | -0.45 |
C1orf54 | -0.42 | -0.50 |
Sycp3 | -0.42 | -0.51 |
AF347015.21 | -0.41 | -0.44 |
SERF2 | -0.41 | -0.45 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27ME1的近代结肠癌HCP | 26 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脑DN中的乳腺癌复发 | 85 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GU PDEF目标 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 | 157 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 | 145 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |