基因页:Faim2
概括?
基因 | 23017 |
象征 | Faim2 |
同义词 | lfg | lfg2 | ngp35 | nmp35 | tmbim2 |
描述 | FAS凋亡抑制分子2 |
参考 | MIM:604306|HGNC:HGNC:17067|ENSEMBL:ENSG00000135472|HPRD:09184|Vega:Otthumg00000169808 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q13 |
Pascal P值 | 0.607 |
Sherlock P值 | 0.2 |
胎儿β | -1.924 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG22522920 | 12 | 50276512 | Faim2 | 1.19E-4 | -0.311 | 0.029 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FAIM2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Zmym4 | 0.94 | 0.97 |
taf2 | 0.94 | 0.95 |
EIF4G2 | 0.94 | 0.96 |
scyl2 | 0.94 | 0.96 |
Smarcad1 | 0.94 | 0.96 |
APAF1 | 0.94 | 0.92 |
CAPN7 | 0.93 | 0.95 |
Vezt | 0.93 | 0.96 |
HSDL1 | 0.93 | 0.96 |
DHX57 | 0.93 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.90 |
HLA-F | -0.74 | -0.80 |
MT-CO2 | -0.73 | -0.91 |
AF347015.27 | -0.73 | -0.88 |
FXYD1 | -0.72 | -0.89 |
AF347015.33 | -0.72 | -0.88 |
AIFM3 | -0.72 | -0.78 |
TSC22D4 | -0.72 | -0.81 |
mt-cyb | -0.71 | -0.88 |
C5orf53 | -0.70 | -0.73 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | nas | 16964429 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006916 | 抗凋亡 | nas | 10535980 | |
去:0006915 | 凋亡 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触,神经递质(GO期限:5) | - |
GO:0045202 | 突触 | IEA | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | - |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
St FAS信号通路 | 65 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FAS路径 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sabates结直肠腺瘤 | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭雷帕霉素的反应 | 203 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期DN | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cheng对醋酸镍的反应 | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein神经元标记 | 69 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼中的Smid乳腺癌复发 | 97 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌ERBB2 UP | 147 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 | 104 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 | 204 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-326 | 1137 | 1143 | M8 | HSA-MIR-326 | ccucugggcccuccag |