概括
基因 23017
象征 Faim2
同义词 lfg | lfg2 | ngp35 | nmp35 | tmbim2
描述 FAS凋亡抑制分子2
参考 MIM:604306|HGNC:HGNC:17067|ENSEMBL:ENSG00000135472|HPRD:09184|Vega:Otthumg00000169808
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q13
Pascal P值 0.607
Sherlock P值 0.2
胎儿β -1.924
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG22522920 12 50276512 Faim2 1.19E-4 -0.311 0.029 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Zmym4 0.94 0.97
taf2 0.94 0.95
EIF4G2 0.94 0.96
scyl2 0.94 0.96
Smarcad1 0.94 0.96
APAF1 0.94 0.92
CAPN7 0.93 0.95
Vezt 0.93 0.96
HSDL1 0.93 0.96
DHX57 0.93 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.74 -0.90
HLA-F -0.74 -0.80
MT-CO2 -0.73 -0.91
AF347015.27 -0.73 -0.88
FXYD1 -0.72 -0.89
AF347015.33 -0.72 -0.88
AIFM3 -0.72 -0.78
TSC22D4 -0.72 -0.81
mt-cyb -0.71 -0.88
C5orf53 -0.70 -0.73

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 nas 16964429
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006916 抗凋亡 nas 10535980
去:0006915 凋亡 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0045211 突触后膜 IEA 突触,神经递质(GO期限:5) -
GO:0045202 突触 IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
St FAS信号通路 65 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAS路径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sabates结直肠腺瘤 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期DN 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheng对醋酸镍的反应 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein神经元标记 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼中的Smid乳腺癌复发 97 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 104 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 206 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-326 1137 1143 M8 HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag