基因页：myo16
概括？
| 基因 | 23026 |
| 象征 | myo16 |
| 同义词 | myap3 | myr8 | myo16b | nyap3 | ppp1r107 |
| 描述 | 肌球蛋白XVI |
| 参考 | MIM：615479|HGNC：HGNC：29822|Ensembl：ENSG0000000041515|HPRD：14795|Vega：Otthumg0000000017333 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 13Q33.3 |
| Pascal P值 | 0.026 |
| Sherlock P值 | 0.355 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26899526 | 13 | 109794149 | myo16 | 8.36e-5 | 0.459 | 0.026 | DMG：Wockner_2014 |
| CG24425807 | 13 | 109741176 | myo16 | 3.71E-4 | 0.699 | 0.043 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KIAA1219 | 0.95 | 0.96 |
| hectd1 | 0.95 | 0.96 |
| FAM160B1 | 0.94 | 0.96 |
| RNMT | 0.94 | 0.95 |
| ZBTB38 | 0.93 | 0.94 |
| USP9X | 0.93 | 0.95 |
| gnaq | 0.93 | 0.96 |
| Bag5 | 0.93 | 0.95 |
| CPEB4 | 0.93 | 0.95 |
| zyg11b | 0.93 | 0.96 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.71 | -0.76 |
| MT-CO2 | -0.69 | -0.76 |
| higd1b | -0.68 | -0.76 |
| AF347015.31 | -0.68 | -0.74 |
| HSD17B14 | -0.66 | -0.71 |
| TLCD1 | -0.66 | -0.71 |
| 增强 | -0.66 | -0.76 |
| AC021016.1 | -0.65 | -0.70 |
| ifi27 | -0.65 | -0.72 |
| AF347015.33 | -0.65 | -0.69 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003774 | 运动活动 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0051015 | 肌动蛋白丝结合 | ISS | 11588169 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0021549 | 小脑发育 | ISS | 大脑（GO期限：10） | 11588169 |
| 去：0008285 | 细胞增殖的阴性调节 | ISS | 17029291 | |
| GO：0045749 | 有丝分裂细胞周期的S相的负调控 | ISS | 17029291 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005654 | 核质 | 艾达 | 17029291 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | ISS | 11588169 | |
| 去：0005886 | 质膜 | ISS | 11588169|17029291 | |
| GO：0048471 | 细胞质的核周区 | 艾达 | 17029291 | |
| GO：0016459 | 肌球蛋白复合物 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Yagi AML Fab标记 | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |