SZGR2 - Beplay体育中心

概括？

基因	23028
象征	KDM1A
同义词	AOF2 \| BHC110 \| CPRF \| KDM1 \| LSD1
描述	赖氨酸脱甲基酶1a
参考	MIM：609132\|HGNC：HGNC：29079\|ENSEMBL：ENSG00000004487\|HPRD：09800\|Vega：Otthumg00000003220
基因类型	蛋白质编码
地图位置	1p36.12
Pascal P值	0.465
Sherlock P值	0.317
胎儿β	1.795
主持人	迈尔斯的顺式和跨性别
支持	Ascano FMRP目标染色质重塑基因

数据源中的基因

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
PMID：cooccur	高通量文献搜索	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	PVALUE	QVALUE	TSS距离	EQTL类型
RS4854166	CHR2	3297005	KDM1A	23028		0.18		反式
RS6902183	CHR6	121963786	KDM1A	23028		0.15		反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	官方全名b	实验	资源	PubMed ID
AOF2	BHC110 \|KDM1 \|KIAA0601 \|LSD1	胺氧化酶（含黄素）结构域2	亲和力捕获ms	Biogrid	12493763
ASCC2	ASC1P100	激活信号协调器1复合亚基2	两个杂交	Biogrid	16169070
ATP5J2	ATP5JL	ATP合酶，H+转运，线粒体F0复合物，亚基F2	两个杂交	Biogrid	16169070
CCDC90B	MDS011 \|MDS025 \|MGC104239	包含90b	两个杂交	Biogrid	16169070
GDF9	-	生长分化因子9	两个杂交	Biogrid	16169070
gtf2i	BAP-135 \|BAP135 \|BTKAP1 \|diws \|FLJ38776 \|FLJ56355 \|IB291 \|自旋\|tfii-i \|WBS \| WBSCR6	一般转录因子II，I	亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12493763
HDAC1	DKFZP686H12203 \|gon-10 \|HD1 \|RPD3 \|RPD3L1	组蛋白脱乙酰基酶1	-	HPRD，Biogrid	12493763
HDAC2	RPD3 \|yaf1	组蛋白脱乙酰基酶2	亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩共纯化	Biogrid	9804427\|12032298 \|12493763
Hist3H3	H3.4 \|H3/g \|H3FT \|H3T \|MGC126886 \|MGC126888	组蛋白簇3，H3	LSD1与H3相互作用并脱甲基。	绑定	15620353
HMG20B	Braf25 \|Braf35 \|FLJ26127 \|HMGX2 \|PP7706 \|Smarce1r \|Soxl \|PP8857	高动力组20B	亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩共纯化	Biogrid	12032298\|12493763
immt	DKFZP779P1653 \|HMP \|MGC111146 \|P87 \|P87/89 \|P89 \|Pig4 \|PIG52	内膜蛋白，线粒体（线粒体）	两个杂交	Biogrid	16169070
KIAA0182	GSE1	KIAA0182	亲和力捕获ms	Biogrid	12493763
PHF21A	BHC80 \|BM-006 \|KIAA1696	PhD手指蛋白21A	-	HPRD，Biogrid	15325272
RCOR1	Corest \|KIAA0071 \|rcor	REST COREPRESSOR 1	亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩共纯化	Biogrid	11171972\|12032298
setDB1	eset \|kg1t \|KIAA0067 \|KMT1E	设定域，分叉1	两个杂交	Biogrid	16169070
sin3a	DKFZP434K2235 \|FLJ90319 \|KIAA0700	SIN3同源物A，转录调节剂（酵母）	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	11171972
UNC119	HRG4	UNC-119同源物（秀丽隐杆线虫）	两个杂交	Biogrid	16169070
Zmym2	fim \|Mym \|坡道\|scll \|ZNF198	锌指，mym型2	亲和力捕获ms	Biogrid	12493763
Zmym3	DXS6673E \|KIAA0385 \|Mym \|xfim \|ZNF198L2 \|ZNF261	锌指，mym型3	亲和力捕获ms	Biogrid	12493763
ZNF217	ZABC1	锌指蛋白217	亲和力捕获ms	Biogrid	12493763

V.途径注释

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
PID Notch途径	59	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AR途径	61	46	该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid his hey pathway	48	39	该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素	132	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血	466	331	该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN	663	425	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤	305	185	该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn	800	473	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中	390	236	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络	423	265	该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标	957	597	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN	517	309	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES核心九相关	100	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向	266	171	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN	187	122	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans	882	572	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌遗传与零星	50	32	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2	163	113	该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应	271	175	该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向	566	371	该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3	97	72	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN	238	145	该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课	605	377	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up	756	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关	682	440	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up	548	370	该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro	177	132	该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚	317	190	该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN	211	119	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：KDM1A

第一节遗传学和表观遗传学注释

EQTL注释

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

时间变化的基因表达（brainspan）

大脑区域没有共表达基因

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

V.途径注释