基因页面:RBM34
总结吗?
GeneID | 23029年 |
象征 | RBM34 |
同义词 | - - - - - - |
描述 | RNA结合主题蛋白质34 |
参考 | HGNC: HGNC: 28965|运用:ENSG00000188739|HPRD: 11065|织女:OTTHUMG00000039620 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 1 q42.3 |
胎儿β | 0.842 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg09144196 | 1 | 235324804 | RBM34 | 5.89 e-9 | -0.013 | 3.16 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs12255258 | chr10 | 106306927 | RBM34 | 23029年 | 0.14 | 反式 | ||
rs1507047 | chr16 | 50932778 | RBM34 | 23029年 | 0.16 | 反式 | ||
rs6128541 | chr20 | 57917688 | RBM34 | 23029年 | 0.05 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RBM34_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SLC35E1 | 0.91 | 0.92 |
ZNF236 | 0.91 | 0.91 |
FOXK2 | 0.91 | 0.91 |
RAI1 | 0.90 | 0.91 |
BICD2 | 0.90 | 0.93 |
DHX33 | 0.90 | 0.92 |
DGCR2 | 0.90 | 0.91 |
ZC3H7B | 0.90 | 0.91 |
FAM168A | 0.90 | 0.92 |
NDST1 | 0.90 | 0.91 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.69 | -0.73 |
AF347015.21 | -0.67 | -0.77 |
HIGD1B | -0.67 | -0.72 |
MT-CO2 | -0.67 | -0.71 |
C1orf54 | -0.66 | -0.79 |
FXYD1 | -0.65 | -0.68 |
GNG11 | -0.64 | -0.71 |
VAMP5 | -0.63 | -0.68 |
IFI27 | -0.63 | -0.65 |
MT-CYB | -0.62 | -0.66 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
钟阿扎胞苷和TSA | 183年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TURASHVILI乳腺导管癌和小叶正常 | 73年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUIFFE入侵被腹水DN | 145年 | 91年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LAIHO大肠癌锯齿状的 | 112年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TIEN肠道益生菌6小时DN | 167年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TIEN肠道益生菌24小时 | 557年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应有限合伙人 | 431年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺未分化癌 | 722年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN SCHLOSSER血清反应 | 712年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼转移DN | 261年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
八木AML生存 | 129年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
击倒老化肌肉了 | 244年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织 | 174年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林NPAS4目标了 | 163年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOYAULT肝癌子类G12 | 39 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HOSHIDA肝癌生存 | 73年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
开罗肝胚细胞瘤了 | 207年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
开罗肝脏发展起来 | 166年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |